Essential parameters for use in epidemiological models of COVID-19 in Argentina: a rapid review

Abstract

INTRODUCCIÓN: Los modelos de simulación para COVID-19 requieren una serie de parámetros epidemiológicos que varían en base a cuestiones propias de cada región y al momento de la pandemia que se esté atravesando. OBJETIVO: Esta revisión rápida presenta los parámetros epidemiológicos esenciales potencialmente utilizables en Argentina. MÉTODOS: Se realizó una búsqueda en las principales bases de datos y en buscadores de artículos en estado de preimpresión (preprints) de parámetros relacionados con la propagación del virus y evolución de la enfermedad, y el uso del sistema de salud. Para revisar los artículos seleccionados se utilizó una herramienta de evaluación de calidad apropiada al diseño del estudio. RESULTADOS: De las variables relacionadas con la propagación y evolución; el período de incubación es de 5,8 días (intervalos de confianza [IC95%]: 4,83-6,85), el período de infecciosidad es de 6,25 días (IC95%: 5,09-7,51), el número básico de reproducción es de 3,32 (IC95%: 3,24-3,39), y la tasa de fatalidad en pacientes infectados fue de 0,64% (IC95%: 0,5-0,78). De las variables relacionadas con el uso del sistema de salud, el tiempo de internación hospitalaria es de 5 días (rango intercuartílico [RIC]: 3-9), el tiempo de internación en una unidad de cuidados intensivos (UCI) es de 7 días (RIC: 4-11), el porcentaje de pacientes internados que requieren de UCI es de 26% (IC95%: 20-33) y, de estos, el porcentaje que requieren de ventilación mecánica es de 69% (IC95%: 61-75). DISCUSIÒN: Estudios recientes y datos de acceso públicos a nivel nacional muestran valores distintos a los relevados de la bibliografía internacional. La información recolectada en este trabajo puede contribuir a informar futuros modelamientos y tableros de control para predecir la dinámica de la epidemia en Argentina.INTRODUCTION: Simulation models for COVID-19 require a set of epidemiological parameters that vary according to regional issues and the timing of the pandemic. OBJECTIVE: This rapid review presents the essential epidemiological parameters potentially usable in Argentina. METHODS: A search of the main databases and search engines for articles in preprint status (preprints) of parameters related to the spread of the virus and evolution of the disease, and the use of the health system was carried out. A quality assessment tool appropriate to the study design was used to review the selected articles. RESULTS: Of the variables related to the spread and evolution; the incubation period is 5.8 days (confidence intervals [CI95%]: 4.83-6.85), the infectious period is 6.25 days (CI95%: 5.09-7.51), the basic reproduction number is 3.32 (CI95%: 3.24-3.39), and the fatality rate in infected patients was 0.64% (CI95%: 0.5-0.78). Of the variables related to health system use, the length of hospital stay was 5 days (interquartile range [IQR]: 3-9), the length of stay in an intensive care unit (ICU) was 7 days (IQR: 4-11), the percentage of hospitalized patients requiring ICU was 26% (CI95%: 20-33) and, of these, the percentage requiring mechanical ventilation was 69% (CI95%: 61-75). DISCUSSION: Recent studies and publicly available data at the national level show values different from those reported in the international literature. The information collected in this work may contribute to inform future modeling and dashboards to predict the dynamics of the epidemic in Argentina.Fil: Argento, Fernando Javier. Instituto de Efectividad Clínica y Sanitaria; ArgentinaFil: Rodriguez Cairoli, Federico. Instituto de Efectividad Clínica y Sanitaria; ArgentinaFil: Perelli, Lucas. Instituto de Efectividad Clínica y Sanitaria; ArgentinaFil: Augustovski, Federico Ariel. Instituto de Efectividad Clínica y Sanitaria; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Pichon Riviere, Andrés. Instituto de Efectividad Clínica y Sanitaria; ArgentinaFil: Bardach, Ariel Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones en Epidemiología y Salud Pública. Instituto de Efectividad Clínica y Sanitaria. Centro de Investigaciones en Epidemiología y Salud Pública; Argentin

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