Stinkbugs (Hemiptera: Pentatomidae) are of major economic importance as pest of crops. Among the species composing the stinkbug complex, Nezara viridula is one of the most abundant in Brazil, Argentina and the Southern USA. However, this species has been poorly characterized at the genetic and physiological level. Here we sequenced and analyzed the complete transcriptome of N. viridula male and female adults. We identified neuropeptide precursor genes and G-protein coupled receptors for neuropeptides in this transcriptome. Mature neuropeptides were identified in N. viridula brain extracts by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. We also analyzed the neuropeptide precursor complement in the genome sequence of Halyomorpha halys, another pentatomid of economic relevance. We compared the results in both pentatomids with the well-characterized neuropeptide repertoire from the kissing bug Rhodnius prolixus (Hemiptera: Reduviidae). We identified both group-specific features (which could be related to the different feeding habits) and similarities that could be characteristic of Heteroptera. This work contributes to a deeper knowledge of the genetic information of these pests, with a focus on neuroendocrine system characterization.Fil: Lavore, Andres Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Bioinvestigaciones (Sede Pergamino); ArgentinaFil: Pérez Gianmarco, Lucila Maité. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Bioinvestigaciones (Sede Pergamino); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Esponda Behrens, Natalia Irene. Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genómicos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Palacio, Victorio Gabriel. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Bioinvestigaciones (Sede Pergamino); ArgentinaFil: Catalano, María Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Bioinvestigaciones (Sede Pergamino); ArgentinaFil: Rivera Pomar, Rolando. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Bioinvestigaciones (Sede Pergamino); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genómicos; ArgentinaFil: Ons, Sheila. Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genómicos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin