Classification of dermatophytes by a multilocus phylogenetic approach based on tef-1α, beta tubulin and its genes

Abstract

Trabalho Final de Mestrado Integrado, Ciências Farmacêuticas, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia, 2019Os dermatófitos são fungos que têm a capacidade de invadir tecidos queratinizados de humanos e de outros animais. As infecções causadas por dermatófitos são comumente conhecidas como tinhas, e podem afetar a pele, cabelos e unhas. Este estudo diz respeito a Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton interdigitale, Trichophyton violaceum e Trichophyton soudanense, quatro espécies conhecidas por causar Tinea capitis, uma infecção que afeta os folículos capilares sendo predominantemente uma doença que afecta crianças pré-adolescentes. Embora as dermatofitoses não sejam consideradas de natureza urgente, são um problema de Saúde Pública. O aumento dramático da incidência das dermatofitoses e a necessidade de aumentar o nosso conhecimento acerca da ecologia e epidemiologia dos dermatófitos têm implicado uma investigação mais intensa em métodos de diagnóstico para identificação rápida e precisa destes patogéneos fúngicos. A filogenia dos dermatófitos, no entanto, permanece incerta, porque os seus membros são filogeneticamente e taxonomicamente muito próximos e as suas características fenotípicas às vezes são precárias. Este trabalho descreve uma tentativa de um método de identificação de dermatófitos, usando a sequenciação de DNA fúngico de três genes específicos, ITS, BT2 e Tef-1α para identificar filogeneticamente e distinguir T. mentagrophytes de T. interdigitale e T. violaceum de T. soudanense, uma vez que foram identificados erroneamente ao longo dos anos, a fim de fornecer informações sobre a sua taxonomia e promover a possibilidade de efetuar uma terapia direcionada.Dermatophytes have the capacity to invade human keratinized tissues and other animals to produce infections, dermatophytosis. Dermatophyte infections are commonly known as ringworm or Tinea, and can affect the skin, hair and nails. This study concerns Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton interdigitale, Trichophyton violaceum and Trichophyton soudanense, four species known to cause Tinea capitis, an infection that affects the hair follicles. It is predominantly a disease of preadolescent children. Although a dermatophyte infection is not an emergency, the dramatic increase in the incidence of opportunistic fungal infections and the need to increase our knowledge of the dermatophytes ecology and epidemiology has led to a critical need for diagnostic methods that can rapidly and accurately identify fungal pathogens. The phylogeny of dermatophytes, however, remains unclear because their members are phylogenetically and taxonomically very closely related, and their phenotypic features are sometimes poor. This project describes an attempt to establish a method of identification of dermatophytes by sequencing the fungus DNA, Internal transcribed spacer (ITS) , Beta tubulin gene (BT2) and the nucleotide sequence of translation elongation factor 1-α (Tef-1α) were used as tools to identify phylogenetically these four species, and distinguish T. mentagrophytes from T. interdigitale and T. violaceum from T. soudanense, since they have been misidentified over the years, in order to provide information about their taxonomy and promote the possibility for a targeted therapy.Centre Hospitalier Universitaire de Liège; Farmácia Oriental de Lisboa; Hospital Cuf Descoberta

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