A Mecânica Quântica apresenta complexa estrutura conceitual e filosófica que se reflete além da teoria colocando, inclusive, em questionamento as estruturas de construção da Ciência. As interpretações e modelos propostos pela teoria quântica são estruturantes de duas grandes ciências naturais: a Física e a Química. Contudo, uma análise dos documentos oficiais e de trabalhos em epistemologia das ciências naturais mostra que estas duas ciências se distanciam nestes âmbitos. No presente trabalho buscou-se tal dicotomia no ideário de licenciandos em Física e Química dentro das representações referentes aos modelos atômicos e à ligação covalente. O ideário obtido, através do método fenomenológico e analisado à luz da perspectiva bachelardiana denota representações que equivalem às apresentadas por alunos do ensino médio além da dicotomia pressuposta entre os modelos da Física e da Química no que se refere ao uso da matemática e de recursos pictóricos
