Isolation and characterization of rhizobia associated with peanut (Arachis hypogaea L.'Tainan selection NO.9')

Abstract

花生（Arachis hypogaea L.）在豆科作物當中不僅是屬於具經濟價值作物，也是屬於農業上很重要的糧食作物，而豆科作物也因為能與根瘤菌共生結瘤進行生物固氮作用，將空氣中的氮氣透過存在於根瘤當中的一連串機制來轉換為植物可以利用的形式，因此更屬於值得研究與探討的作物之一，也希冀能夠從根瘤當中分離得到具有促進植物生長之根瘤菌，並在未來能夠開發做為生物肥料使用。本研究利用酵母萃取物甘露醇培養基對臺南九號花生根瘤內存在之細菌進行菌株的篩選，經過16S rDNA親源分析結果發現臺南九號花生根瘤內除了有快生型根瘤菌（Rhizobium）以及慢生型根瘤菌（Bradyrhizobium）的存在之外，亦分離出了包含芽孢桿菌屬（Bacillus）、伯克氏菌屬（Burkholderia）、克雷伯氏菌屬（Klebsiella）、長野雷夫松氏菌屬（Leifsonia），上述菌數分別歸類於α-變形菌綱（Alphaproteobacteria）、β-變形菌綱（Betaproteobacteria）、γ-變形菌綱（Gammaproteobacteria）、放線菌綱（Actinobacteria）以及芽孢桿菌綱（Bacilli）。自上述菌株當中挑選7株根瘤菌株Rhizobium mesosinicum E2BF1 、 Rhizobium tropici E4CF1 、 Rhizobium tropici E4CF2 、 Bradyrhizobium guangxiense A1CS1 、 Bradyrhizobium ottawaense A1DS1 、 Bradyrhizobium ottawaense A1ES1 以及 Bradyrhizobium subterraneum VWNS1 ，並增加參考菌株 Bradyrhizobium diazoefficiens BCRC 13528 進行促進植物生長潛力分析。在游離固氮能力分析中，除了BCRC 13528之外，5株分離菌株E4CF2、A1CS1、A1DS1、A1ES1以及VWNS1同樣的也具有游離固氮活性，當中以VWNS1之活性表現最好，培養7天之菌株活性達5.48992 nmol / hr；在溶磷能力分析中，僅有E4CF1在磷酸三鈣固態培養基上有溶圈的形成，但在活性的部分包含BCRC 13528在內，同樣的也有5株分離菌株具有溶磷活性，其中又以E4CF1、E4CF2、VWNS1表現最佳，培養5-7天之菌液均可產生高於100 μg/mL之水溶性磷含量；在IAA合成能力分析中，BCRC 13528以及所有的分離菌株培養4-5天後均發現具有合成IAA的能力，生成量介於1.471861 μg/mL與42.46753 μg/mL之間。研究中挑選4株菌針對不同來源（彰化、台中、雲林）之臺南九號花生種子進行蛭石回接實驗，結果發現彰化來源的種子經過8週栽培後在每種接菌處理下植株根系均有著生根瘤，其中VWNS1的接菌處理形成的根瘤數量最多，推測接種源自於種子之內生根瘤菌VWNS1與此來源種子之相容性較佳，其他兩種來源在A1ES1以及VWNS1的處理下植株根系亦可著生根瘤。摘要 i Abstract ii 目次 iii 表次 v 圖次 vi 前言 1 前人研究 2 一、花生 2 二、花生根瘤菌 3 (一)根瘤菌之結瘤過程 3 (二)花生根瘤中常見之根瘤菌 3 三、促進植物生長細菌 5 (一)根瘤菌之固氮作用 6 (二)根瘤菌之溶磷作用 9 (三)根瘤菌之吲哚乙酸合成作用 10 材料與方法 13 一、研究架構 13 二、花生根瘤內細菌之分離 15 (一)花生植株根系採集 15 (二)根瘤內之菌株分離與純化 15 (三)菌種保存 17 (四)細菌之親緣分析 18 三、花生根瘤菌株之植物生長促進特性分析 21 (一)游離固氮能力分析 21 (二)溶磷能力分析 26 (三)吲哚乙酸合成能力分析 29 四、蛭石瓶栽回接試驗 31 (一)種子來源及處理 31 (二)蛭石瓶栽試驗設計 33 (三)植株生長根瘤形成及共生固氮活性測試 35 (四)根瘤內生菌分離 36 結果與討論 37 一、花生根瘤內之細菌分離 37 二、花生根瘤菌菌株之促進植物生長特性分析 43 (一)游離固氮能力分析 45 (二)溶磷能力分析 47 (三)吲哚乙酸合成能力分析 50 三、不同來源之臺南九號花生種子於蛭石瓶栽回接試驗 52 (一)彰化來源臺南九號花生種子回接試驗 52 (二)台中來源臺南九號花生種子回接試驗 61 (三)雲林來源臺南九號花生種子回接試驗 67 (四)三種不同來源的綜合比較與討論 73 (五)回接試驗所生成之根瘤當中內生菌分離 76 結論 78 參考文獻 79 附錄 8