Sequenziato il genoma più grande del mondo: è di una conifer

MANDRIOLI, Mauro

Archivio istituzionale della ricerca - Università di Modena e Reggio Emilia

13/7/2017 Genomi giganti alla riscossa | Pikaiahttp://pikaia.eu/genomi-giganti-alla-riscossa/ 1/2Biologia molecolare Botanica e ZoologiaSequenziato il genoma più grande del mondo: èdi una conifera27 marzo 2014 Mauro Mandrioli Genomi giganti alla riscossaQuando nel giugno del 2000 Francis Collins delNational Human Genome Research Institute (NHGRI)e John Craig Venter di Celera hanno annunciato ilcompletamento del progetto di sequenziamento delgenoma umano, la comunità scientifica ha avuto laprima dimostrazione sperimentale del fatto chepotessero essere sequenziati (ed assemblaticorrettamente!) anche genomi di grandi dimensioni.Prima del genoma umano (3 gigabasi, Gb), erano statisequenziati infatti genomi di dimensioni decisamenteinferiori, tra cui i genomi dei lieviti Saccharomycescerevisiae e Schizosaccharomyces pombe (di meno di15 megabasi, Mb), quello del nematodeCaenorhabditis elegans (100 Mb) e lasequenza completa del genoma delmoscerino della frutta Drosophilamelanogaster (poco meno di 120 Mb).Nel corso dell’ultimo decennio si è datagrande enfasi al fatto che le metodiche disequenziamento sono divenute sempre piùefficaci ed economiche, ma forse non si è data una adeguata attenzione al fatto che tale progresso tecnologicosta portando al sequenziamento anche di genomi grandi (per non dire enormi!). Ne è un esempio il genomadella conifera Pinus taeda, recentemente pubblicato sulla vista Genome Biology che con le sue 23.2 Gb ècirca 7 volte più grande del genoma umano.Un ulteriore aspetto di interesse è che, come già fatto per il genoma del panda gigante (2 Gb), il progettogenoma è stato condotto avvalendosi delle nuove tecnologie di sequenziamento massivo che permettono disequenziare un genoma in modo estremamente più veloce ed economico rispetto alla tecnologia Sanger usatasinora.Se per decenni la scelta dei modelli biologici di cui sequenziare il genoma è stata soggetta al vincolo delledimensioni del genoma, l’articolo di Neale et al. su Genome Biology mostra invece come ad oggi siamopienamente entrati nel secolo della genomica per tutti. Colpisce infine notare che nel 2004 era stata pubblicatala prima sequenza completa del genoma di un albero, il pioppo nero americano, che era stato annunciata comeun grande successo poiché il genoma del pioppo (480 Mb) era grande circa quattro volte quello diArabidopsis thaliana (140 Mb), la prima pianta sequenziata. A distanza di 10 anni  è stato sequenziato consuccesso un genoma circa 50 volte più grande quello del pioppo… non male come risultato!Mauro Mandriolida Il gene irriverenteRiferimenti:Neale, D., Wegrzyn, J., Stevens, K., Zimin, A., Puiu, D., Crepeau, M., Cardeno, C., Koriabine, M., Holtz-Morris, A., et al. (2014). Decoding the massive genome of loblolly pine using haploid DNA and novelassembly strategies. Genome Biology, 15 (3) DOI: 10.1186/gb-2014-15-3-r59Credit: Soil-Science.info, da Wikimedia CommonsCondividi:2     13/7/2017 Genomi giganti alla riscossa | Pikaiahttp://pikaia.eu/genomi-giganti-alla-riscossa/ 2/2

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