Les facteurs virologiques et immunologiques impliqués dans la persistance du virus de l'hépatite E (VHE) et dans la fibrose hépatique nécessitent d'être mieux caractérisés. L'hétérogénéité de la quasi-espèce virale au moment de la phase aiguë a été étudiée au niveau de la polyprotéine non structurale (ORF1) et de la protéine de capside (ORF2). Nos résultats ont montré qu'une plus grande hétérogénéité de la quasi-espèce à la phase aiguë était associée à la persistance du VHE. Chez les patients développant une infection chronique, une plus faible concentration sérique de cytokines inflammatoires, une plus faible activation des lymphocytes T et de fortes concentrations sériques en chimiokines ont été observées. Chez les patients chroniquement infectés, la plus faible diversification de la quasi-espèce lors de la première année d'infection était associée à la progression de la fibrose hépatique. Lors du suivi de l'évolution du génome du VHE chez un patient chroniquement infecté, peu de variations de la séquence consensus ont été observées mais une insertion de fragment de gène humain a été caractérisée. Cette découverte ouvre de nouvelles perspectives dans la compréhension de l'adaptation du VHE à son hôteIdentification of factors influencing HEV persistence and liver fibrosis is needed. The relationship between quasispecies heterogeneity and the outcome of the acute phase was studied in the non structural polyprotein (ORF1) and the capside protein (ORF2). We have shown that great quasispecies heterogeneity was associated with HEV persistence. In addition, weak inflammatory response, low T-cell activation and high serum concentrations of the chemokines implicated in leukocyte recruitment to the liver were also associated with HEV persistence. Patients with chronic infection and progressing liver fibrosis had less quasispecies diversification during the first year. Study of the genome evolution during a chronic infection has shown a limited number of mutations over time and a virus-host recombinant was foun