O objetivo deste trabalho foi identificar as espécies de fitovírus presentes em genótipos de amendoim forrageiro através do sequenciamento de alto desempenho (Next-Generation Sequencing-NGS) e microscopia eletrônica de transmissão

ASSIS, G. M. L. de

BOARI, A. de J.

GONCALVES, R. C.

KITAJIMA, E. W.

MARCHI, B. R. de

PANTOJA, K. F. C.

SAKATE, R. K.

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836 Anais do 51º CBF Recife-PE  | 27 a 30 de Agosto de 2019    Área Virologia  Detecção de um Emaravirus-likeem amendoim forrageiro por sequenciamento de alto desempenho (DetectionofaEmaravirus-like in forage pinto peanutbynextgenerationsequencing) Késsia de Fátima Cunha Pantoja1; Alessandra de Jesus boari2; Elliot Watanabe Kitajima3; Renate Krause Sakate4; Bruno R. De Marchi5; Giselle Mariano Lessa De Assis; Rivadalve Coelho Goncalves. 1Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho-UNESP; 2Embrapa Amazônia Oriental; 3Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz - ESALQ/USP; 4University of Florida Gulf Coast Research&Education Center; 5Embrapa Acre. Email: kessiapantoja66@gmail.com.  Resumo: Arachispintoi (Krapov& W.C. Gregory) é uma leguminosa tropical, pertence à família Fabaceae, usada para finalidades distintas como forrageira, cobertura do solo em pomares, florestas e plantio direto; controle da erosão e como ornamental em projetos paisagistícos. A espécie A. pintoi tem sido usada como safra agrícola no Brasil, Austrália, Colômbia e Bolívia devido ao seu alto valor nutritivo e excelente produção animal em manejo de pastagens. Vinte e seis amostras foliares deA. pintoi do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Acre exibindo sintomas típicos de vírus foram testadas quanto à presença desses fitopatógenos. O objetivo deste trabalho foi identificar as espécies de fitovírus presentes em genótipos de amendoim forrageiro através do sequenciamento de alto desempenho (Next-GenerationSequencing-NGS) e microscopia eletrônica de transmissão. Cortes ultra-finos contrastados com acetato de uranila e examinados ao microscópio eletrônico revelaram a presença de partículas esféricas envelopadas com cerca de ca. 120 nm de diâmetro no citoplasma, similares às descritas para emaravírus. O sequenciamento foi realizado utilizando a plataforma Illumina HiSeq2500 e a montagem de novo das 24.659.442 reads foi realizada usando o software CLC Genomics Workbench v7.0. e posteriormente submetidos a análise tBLASTX (Geneious R8.0). A análise de um fragmento de aproximadamente 3000 nt do RNA1 que codifica para a RNA polimerase revelou identidades de 65,7% e 60% de nucleotídeos e aminoácidos, respectivamente, com as sequências do Blackberryleafmottle-associatedvirus (BLMaV) (gênero Emaravirus, família Fimoviridae). Um par de primers desenhado a partir da sequência do RNA1 confirmou a presença do vírus em dois genótipos de amendoim forrageiro que apresentavam nas folhas o sintoma de mancha anelar clorótica. A baixa identidade da sequência de aminoácidos deste vírus indica putativamente a existência de uma espécie viral ainda não caracterizada infectando amendoim forrageiro, parcialmente relacionada a um membro do gênero Emaravirus.  Palavras-chave:Arachispintoi; NGS; virus Apoio: CNPq; Unipasto; Fapesp 2017/18910-4 Késsia de Fátima C unha P antoja; Alessandra de Jesus Boari; Ell iot Watanabe Kitajima; Re nate Krause Sakate; Bruno R. de Marchi; G iselle Mariano Lessa de Assis; Rivadalve Coelho Gonca lves;    

Detecção de um Emaravirus-like em amendoim forrageiro por sequenciamento de alto desempenho.

Detecção de um Emaravirus-like em amendoim forrageiro por sequenciamento de alto desempenho (Detection of aEmaravirus-like in forage pinto peanut by next generation sequencing) Pantoja, K. F. C. 1; boari, A. J. 2; Kitajima, E. W. 3; Sakate, R. K. 4; Marchi, B. R. D. 5; Assis, G. M. L. D. ; Goncalves, R. C. . 1Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho-UNESP; 2Embrapa Amazônia Oriental; 3Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz - ESALQ/USP; 4University of Florida Gulf Coast Research & Education Center; 5Embrapa Acre. Email: kessiapantoja66@gmail.com. Késsia de Fátima C unha P antoja; Alessandra de Jesus Boari; Ell iot Wata nabe Kitajima; Re nate Krause Sa kate; Bruno R. de Marchi; Giselle Mariano Lessa de Assis; Riva dalve Coelho Gonca lves;   

https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/1111917/1/26851.pdf

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