Objetivou-se com esse trabalho avaliar os efeitos do alagamento do solo no desenvolvimento de plantas jovens de 16 progênies de cupuaçuzeiro, para selecionar materiais com possíveis mecanismos de tolerância ao alagamento. O experimento foi conduzido em casa de vegetação da Embrapa Amazônia Oriental, Belém-PA, utilizando delineamento experimental inteiramente casualizado, arranjados em esquema fatorial de 16 x 2, com quatro repetições. Os tratamentos foram 16 progênies de cupuaçuzeiro e os dois regimes hídricos (alagado e controle). Foram analisadas variáveis morfológicas durante 45 dias. O estudo identificou que os materiais avaliados foram beneficiados pelo alagamento em todas variáveis analisadas. Nessas condições, os melhores acréscimos médios para as variáveis analisadas foram obtidos pelas progênies 32, 42, 46, 57 e 215, pelo fato desses materiais terem apresentado os maiores valores médios para a maioria dos parâmetros morfológicos avaliados, indicando boa capacidade de sobrevivência em solos alagados ou de transiçãoResumos expandidos do XIII Curso de Inverno de Genética