PublishedTrabajo financiado por el Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, proyecto RTA2011-00140-d0T-0

Cubero, J.

Garita Cambronero, J.

Palacio Bielsa, Ana

Sena, M.

citaREA Repositorio Electrónico Agroalimentario

RESÚMENES DE COMUNICACIONES ORALES44Sesión simultánea 2: Interacción Planta-Microorganismo ISIM2-1-01219SECUENCIA DEL GENOMA DE UNA CEPA ESPAÑOLA DE Xanthomonas arboricola pv. pruni AISLADA DE ALMENDROGarita-Cambronero J.1, Sena M.1, Palacio-Bielsa A.2, Cubero J.11) Laboratorio de Bacteriología. Departamento de Protección Vegetal, Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA)2) Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón (CITA)Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap), organismo de cuarentena en la UE, es el agente causal de la mancha bacteriana de frutales de hueso, almendro y ornamentales del género Prunus. En España se HCDMSHƥB®ONQOQHLDQ@UDYDM BST@KLDMSDK@L@MBG@A@BSDQH@M@CDKNRPrunus se considera una enfermedad emergente a nivel español y europeo.En trabajos anteriores se caracterizó molecular y fenotípicamente una colección de cepas españolas de Xap. Una de ellas, CITA33 (aislada de almendro), se seleccionó como representativa de las cepas españolas, con el objetivo de realizar estudios comparativos con otras cepas de Xap así como con cepas de otros patovares de X. arboricola.El genoma de CITA33 se obtuvo mediante la tecnología Ion Torrent. El ensamble de novo se realizó BNM DK OQNFQ@L@ HMENQLSHBN "+" &DMNLHBR 6NQJAQDMBG  NASDMH¤MCNRD TM@ RDBTDMBH@ CDOA&"BNMSDMHC@DMřBNMSHFRŚ+@@MNS@BH®M@TSNLSHB@RDKKDU®@B@ANLDCH@MSD SQDROK@S@ENQL@RCHRSHMS@R ! 2XR1 23 ř/QNJ@QXNSHB&DMNLD MMNS@SHNM/HODKHMDŚ Xla predicción de los ARNr y ARNtt mediante los programas RNAmmer 1.2 y tRNAscan-SE 1.21. De DRS@L@MDQ@RDCDSDBS@QNMRDBTDMBH@RBNCHƥB@MSDR 1-QX 1-SPTDQDOQDRDMS@Msubsistemas. El análisis comparativo del ARNr 16S mediante BLASTn detectó 99-100% de similitud con otras especies de Xanthomonas. Asimismo, la comparación del genoma completo determinó que la secuencia obtenida tiene un 99% de similitud con las secuencias preliminares de tres genomas de Xap (MAFF301420, MAFF301427 y MAFF31562).La información generada en este estudio contribuirá a una mejor comprensión de los mecanismos moleculares de la interacción planta-Xap, así como a la determinación de las relaciones existentes entre CITA33 y otras cepas españolas de Xap consideradas atípicas cuya secuenciación y análisis se está llevando a cabo actualmente.3Q@A@IN ƥM@MBH@CN ONQ DK (MRSHSTSN -@BHNM@K CD (MUDRSHF@BH®M X 3DBMNKNF¨@  FQ@QH@ X  KHLDMS@QH@ OQNXDBSN 13 00140-C03-02.

Secuencia del genoma de una cepa española de Xanthomonas arboricola pv. pruni aislada de almendro

http://citarea.cita-aragon.es/citarea/bitstream/10532/2707/1/2014_286.pdf

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