Diversidad filogenética como método de utilidad en programas de conservación de recursos genéticos ganaderos

Abstract

Phylogenetic diversity as a tool in conservation of animal genetic resources The aim of this note is to overview the characteristics of the Phylogenetic Diversity (PD) method in order to quantify genetic diversity in animal genetic resources conservation programs. The PD method performance has been compared with that of the Weitzman approach on a dataset consisting in 398 individuals belonging to 11 Spanish sheep breeds that were genotyped for a set of 14 microsatellites. Results from the PD and the Weitzman methods are similar. However, the PD method is less computing intensive thus allowing for its use at individual level. Moreover the PD does not need the assumption of ultrametricity of the distances. The use of the PD method in livestock conservation programs can be advanteageous with respect the Weitzman approach.El objetivo de esta nota es revisar las características de la metodología de cuantificación de la diversidad conocida como diversidad filogenética (PD), para evaluar su utilización en programas de conservación de recursos genéticos animales. El parámetro PD es uno de los más utilizados en estudios ecológicos pero no se ha utilizado en ganadería. Se ha comparado el rendimiento del método PD con el método filogenético de Weitzman y se ha aplicado a un conjunto de datos consistente en 398 individuos de 11 razas ovinas españolas genotipados para una batería de 14 marcadores microsatélite. Los resultados del método de Weitzman y el método PD tienden a ser similares en los extremos de la ordenación de las razas a efectos de su importancia en la conservación. Sin embargo, el método PD es más sencillo y rápido de calcular, permitiendo su uso rutinario a nivel individual y, además, no asume, al contrario del método de Weitzman, que las distancias deban ser ultramétricas. La utilización del parámetro PD en programas de conservación puede ser ventajosa respecto del método de Weitzman