BARROS, N. E. F.

DAMASO, M. C. T.

FERREIRA, T. S.

OLIVEIRA, E. M. M.

OLIVEIRA, T. C.

TERZI, S. C.

Repository Open Access to Scientific Information from Embrapa

Start | Author Index  1­20: Evaluation of cellulolytic filamentous fungi phenotypes using randomly amplified cDNA with RAPD primers Monday, April 19, 2010LL Conference Facility (Hilton Clearwater Beach)Edna Maria Morais Oliveira1, Natália Eudes Fagundes Barros2, Thiago S. Ferreira3, Tatiane Correa Oliveira1, Selma C. Terzi1 and Monica C.T. Damaso1, (1)Molecular Biology, Embrapa Food Technology, Rio de Janeiro, Brazil, (2)Food Science, University of São Paulo, São Paulo, Brazil, (3)Biological Sciences, University of Nova Iguaçu, Nova Iguaçu, Brazil In recent years, the search for alternative energy sources has demanded a global effort. Due to its abundance, cellulosic biomass stands out, especially when considering agro­industrial residues. However, in order to bio­transform the biomass, the action of an efficient enzyme complex, which includes different cellulases, is necessary. A mutant of Aspergillus niger which produces high levels of this complex was obtained at the Fermentative Processes Laboratory of Embrapa Food Technology. In this light, the aim of this study was to evaluate the phenotypes of the mutant and its parental strain in order to determine the regions of the respective genomes that are related to the expression of the cellulolytic complex. For this purpose, the differentially expressed cDNA fragments were obtained by the cDNA­RAPD technique. The total RNA was obtained using solid state fermentation (SSF) by withdrawing samples at different times (0, 24 and 48 hours) for the mutant and the parental strains, followed by cDNA synthesis and cDNA­RAPD using the Operon kit W (OPW). The cDNA­RAPD profile using OPW11 showed a high difference between the mutant and the parental strains after 48 hours of SSF. The data obtained for the enzymes activity clearly demonstrated a correlation with the expression data. Further studies should be carried out in order to sequence the detected 400bp fragment. This way, it is possible to obtain recombinant strains showing overexpression of the cellulolytic complex. In addition, molecular methods can quickly screen for other microorganisms which have potential for the production of these important enzymes. See more of: Poster Session One Sponsored by GenencorSee more of: General Submissions << Previous Paper | Next Paper >> 

Evaluation of cellulolytic filamentous fungi phenotypes using randomly amplified cDNA with RAPD primers.

RCAAP - Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/878024/1/2010250.pdf

Evaluation of cellulolytic filamentous fungi phenotypes using randomly amplified cDNA with RAPD primers.

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

Repository Open Access to Scientific Information from Embrapa

RCAAP - Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal