La placa dental se considera un modelo especializado de biofilm microbiano, que se forma sobre todos los tejidos intraorales duros y blandos, y representa el principal agente etiológico de la caries y de la enfermedad periodontal. La idea de aplicar un antiséptico oral con fines profilácticos exige analizar su eficacia antimicrobiana en diferentes ecosistemas orales, particularmente en los que presentan características estructurales y fisiológicas diferentes a la saliva, como es el caso de la placa dental. El estudio in vivo de la actividad antibacteriana de un antiséptico supone el análisis de su efecto inmediato y de su sustantividad. Se ha demostrado que la clorhexidina tiene un efecto antibacteriano inmediato y una mayor sustantividad in vivo que otros antisépticos empleados en la cavidad oral. En la mayoría de las series publicadas, la cuantificación de la actividad antimicrobiana de la clorhexidina en saliva se realizó empleando técnicas microbiológicas de cultivo en placa. Sin embargo, algunos autores cuestionaron la fiabilidad de estas técnicas y, como alternativa, propusieron el uso de ensayos fluorescentes que utilizan fluorocromos específicos para marcar bacterias viables y no viables, en base a la integridad de su membrana citoplasmática
