TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.A aids, causada pelo HIV-1, é uma doença caracterizada pela falência do sistema imune e consequente predisposição do organismo a doenças infecciosas. O HIV-1 possui um genoma viral formado por duas cópias lineares de RNA simples fita associado a enzimas necessárias à sua replicação. Entre estas enzimas está a transcriptase reversa (RT), responsável pela síntese do cDNA a partir do RNA viral e que, por não possuir um sistema de reparo, pode gerar 0,2 mutações por genoma por ciclo de replicação. Além disto, a RT possui a capacidade de mudar de substrato durante a transcrição, gerando assim um genoma recombinante entre as duas fitas, que atrelada a esta alta taxa replicativa contribui para o surgimento de uma ampla gama de formas recombinantes circulantes (CRFs). No sul do Brasil a epidemia de HIV/aids apresenta um caráter distinto do panorama nacional, havendo um predomínio dos subtipos C e B (56% e 22% respectivamente) que co-circulam nesta região há aproximadamente 40 anos. Até o momento somente uma CRF havia sido descrita no sul do país (CRF31_BC), refletindo a falta de estudos e consequentemente mascarando o cenário real das formas virais circulantes nesta região do Brasil. No presente estudo foram caracterizadas oito sequências de 1125 pb correspondente ao fragmento que vai da posição 2265 a 3290 do genoma do HIV-1, com um padrão inédito de recombinação entre os subtipos B e C. O primeiro fragmento, que inicia na posição 2265 e termina na posição 2688, corresponde ao subtipo C. O segundo fragmento corresponde ao subtipo B e seu início encontra-se entre as posições 2689 e 2715 (2702, +-13), terminando entre os pontos 3075 e 3087 (3081, +-6). O terceiro e último fragmento corresponde ao subtipo C, iniciando na posição 3088 e terminando na posição 3290. As análises filogenéticas aqui realizadas indicam que este evento de recombinação se deu no Brasil em meados de 1982 (95% de probabilidade: 1979 – 1987). Apesar dos fortes indícios da ocorrência do evento de recombinação aqui apresentados, neste trabalho foi avaliado apenas um pouco mais de 10% de toda a extensão gênica do HIV-1. Assim, as demais regiões gênicas não avaliadas por este estudo podem conter outros pontos de recombinação. Isso torna necessário a realização de mais estudos envolvendo diferentes regiões gênicas do HIV-1 com este padrão de recombinação, incluindo uma caracterização de genomas completos, para a determinação desta como uma nova CRF entre os subtipos B e C do HIV-1
