Succès épidémiologique et contrôle du complexe d'espèces Ralstonia solanacearum à Madagascar et dans le sud-ouest de l'océan Indien

Abstract

Le complexe d'espèces Ralstonia solanacearum (ceRs) est l'agent responsable du flétrissement bactérien, et constitue une contrainte biotique majeure sur les systèmes de cultures maraîchères, fruitières, ornementales et forestières dans toute la ceinture tropicale, subtropicale, de plaine et d'altitude. Il est structuré phylogénétiquement en quatre phylotypes (I, II, III et IV). Les diverses prospections faites dans la zone du sud-ouest de l'Océan Indien (SOOI) aux travers de divers travaux de recherche suggèrent que ces quatre phylotypes se sont installés dans la zone. Néanmoins, leur prévalence diffère considérablement. Ce projet de thèse vise à comprendre les bases moléculaires du succès épidémiologique des lignées prévalentes à Madagascar et dans le SOOI, en comparaison des autres lignées, afin d'évaluer l'efficacité et la durabilité de la résistance d'une accession d'aubergine pour les contrôler. Pour ce faire, les deux axes suivants seront menés en parallèle durant toute la durée de la thèse. En axe 1, les mécanismes moléculaires mis en place par la bactérie pour s'adapter à son hôte et son environnement seront identifiés puis comparés entre lignées très et peu prévalentes. En axe 2, plusieurs accessions d'aubergine seront testées vis-à-vis des lignées très prévalentes afin d'évaluer leur niveau de résistance et les risques de contournement