Écologie du virome des moustiques

Abstract

Nos connaissances sur les virus associés aux moustiques sont largement basées sur des virus infectant les vertébrés, aussi appelés arbovirus. Or, des études récentes ont révélé l'existence d'une large diversité virale associée aux moustiques, dont la plupart des espèces ne semblent pas infecter les vertébrés. De plus, des données encore plus récentes ont montré que la communauté virale peut influencer la transmission du virus de la dengue dans la nature, l'arbovirus ayant le plus grand impact sur la santé humaine. Ces découvertes soulèvent des questions fascinantes à la fois sur les possibles interactions au sein de la communauté virale ou virome, y compris avec les arbovirus, et entre le virome et le moustique. Toutefois, les études sur ces interactions entre arbovirus et virome sont encore quasiment inexistantes. Ce manque de données est principalement dû à notre compréhension limitée de la diversité de viromes dans la nature. Des caractérisations détaillées de cette diversité permettront de mener des études qui testeront l'influence des différents viromes observés sur, entre autres, la transmission d'arbovirus. Une exploration de la diversité virale organisée autour des questions d'écologie est donc requise pour caractériser l'écologie du virome des moustiques. A l'instar de ce que l'on retrouve pour le microbiome, le virome pourrait être structuré par différents facteurs écologiques. Certaines études ont d'ores et déjà mis en avant l'influence de certains facteurs tels que l'espèce hôte ou la distribution géographique sur le virome des moustiques. Néanmoins, les connaissances sur le sujet restent encore très limitées. L'objectif principal de cette thèse est donc d'étudier des facteurs susceptibles de structurer les viromes chez des moustiques vecteurs d'arbovirus. Pour répondre à cet objectif, une exploration de l'influence de plusieurs facteurs sur le virome a été menée sur différentes espèces de moustiques et dans diverses zones géographiques. Les facteurs ciblés ont été l'espèce de moustique hôte, le sexe du moustique, l'habitat (le niveau d'urbanisation), ainsi que le temps (année/mois)