In today’s world lies the importance of identifying biomarkers of toxicity as a preventive way in the presence of various chemical contaminants that act as xenobiotic agents in various organiss, in addition to allowing the evaluation of food safety in various matrices, through the development of new exploratory methodologies such as metabolomics and xenometabolomics. In this way, the objective of this review lies in the analysis in relation to the information reported towards the determination of toxicity biomarkers studied in plants and different food products, in addition to the analysis of the different current applications of omics sciences for the determination of response metabolites. Finally, it seeks to understand the application of metabolomics and xenometabolomics to the identification of biomarkers of toxicity in the environment and in food, in the presence of current pollutants such as pesticides, heavy metals, plastics and microplastics, which allow us to see the importance of these sciences in the identification of biomarkers through the development of omics.En el mundo de hoy se establece la importancia de identificar biomarcadores de toxicidad como una forma preventiva ante la presencia de diversos compuestos químicos contaminantes que actúan como agentes xenobióticos en diversos organismos, además de permitir la evaluación de la inocuidad alimentaria en diversas matrices por medio del desarrollo de nuevas metodologías exploratorias como la metabolómica y la xenometabolómica. De esta forma, el objetivo de esta revisión estriba en el análisis de la información reportada con respecto a la determinación de biomarcadores de toxicidad estudiados en plantas y diferentes productos alimentarios, además del análisis de las diferentes aplicaciones actuales de las ciencias ómicas para la determinación de metabolitos respuesta. Finalmente, se busca comprender la aplicación de la metabolómica y la xenometabolómica frente a la identificación de biomarcadores de toxicidad en el medio ambiente y en los alimentos, ante la presencia de agentes contaminantes actuales como plaguicidas, metales pesados, plásticos y microplásticos, que permiten ver la importancia de estas ciencias en la identificación de biomarcadores mediante el desarrollo de las ómicas