Görögdinnye (Citrullus lanatus) magleletekből (13. sz.,
Debrecen; 15. sz. Buda; 18. sz. Pannonhalma) DNS-izolálást,
molekuláris (nSSR – nuclear simple sequence repeat; cpDNS –
kloroplasztisz DNS) elemzést és fenotípusos fajtarekonstrukciót
végeztünk 44 mai fajtával való összehasonlításban. Az elemzésben
47 primer-párt teszteltünk, ebből 26 primer-pár bizonyult
hatékonynak a mai fajtákban, amelyek közül csak 16 volt aktív a
középkori mintában. Az aktív primerek alkalmazásával szekvencia
elemzést végeztünk a (CT)26-30 nSSR lokuszon, és a clp-12 cpDNS
lokuszon. Megállapítottuk, hogy a középkori mintában még
megtalálható (CT)3 szakasz a mai fajtában már delécióval kiesett
az elmúlt 600 év során. Továbbá a cpDNS trnV (Jarret et al.,
1997) lokuszán (tRNS-Valin; 299 bp) két szubsztitúciót
azonosítottunk (102.196 és a 102.201 nt.-ben). A (CT)26-30 nSSR
lokusz (196 bp) 122-130 bp szakaszán egy további (CT)4 inverziót
is azonosítottunk, amely (CT)26-30 egyszerű mikroszatellita
lokuszból kialakuló (CT)17-C-(TC)3-T-(CT)5 összetett
mikroszatellita születését igazolja. Vizsgálataink során egy új
retrotranszpozont (Cila-1) azonosítottunk. A középkori minta
fajtarekonstrukciójához elkészítettük a 44 mai fajta morfológiai
dendrogramját 25 fenotípusos bélyeg alapján. | The evolution of water melon (Citrullus lanatus)
microsatellites from the 15th century (Debrecen); 13th (Buda); and
18th century, (Pannonhalma) were analyzed. Microsatellite (nSSR,
nuclear simple sequence repeat) and cpDNA profiles of the aDNA
(ancient DNA) of seed remains were compared to modern water
melon cultivars and landraces. Sixteen primer pairs were applied.
Sequence analysis at the (CT)26 and cpDNA trnV loci revealed a
(CT)3 and Adenin deletions, respectively, form the current water
melon cultivar compared to the medieval sample. Cila-1), a new
LTR retrotansposon has been described. For morphological
reconstruction, a dendrogram produced by SPSS11 based on the
presence versus absence of 24 phenotypic characters were also
analyzed
