01.05.2018Herples simplex virüs tip1 (HSV1) keratitis hastalığı, kornea körlüğünün ve mikrobik körlüğün en önemli sebebidir. Herpetik keratitis hastaları ağrı, ışık duyarlılığı, bulanık görüş, göz yaşarması ve kızarıklık yaşarlar. Kornea körlüğü, hastalığın geç tanısı sebebiyle tedavide geç kalınması sonucu oluşur. Tedavide geç kalınmaması için HSV1 virüsünün hızlı ve düşük maliyetle tespit edilmesini sağlayacak bir yöntem veya kit gereklidir. Bu eksikliğin kapatılması için geliştirilecek bir biyosensörde temel ihtiyaç HSV1 ile diğer virüslerin ve özellikle HSV2?nin ayırt edilebilmesini sağlayacak bir işaretçi moleküldür. Antikorlar, hedef moleküllerin seçilmesini sağlayan ve halen yaygın olarak kullanılan peptid temelli biyosensör elemanlarıdır fakat antikorların da kendilerine özgü eksiklikleri vardır. Aptamerler ise, antikorlar kadar yüksek bağlanma özgünlüğüne sahip nükleik asit temelli moleküllerdir. Teorik olarak herhangi bir moleküle özgün olarak bağlanabilen bir DNA veya RNA aptamer molekülü bulunabilir. Aptamerler ile seçilebilecek hedef moleküller ATP kadar ufak olabilmektedir ve DNA aptamerleri biyosensörlerde kullanılmak için gerekli stabiliteye sahiptir. HSV1 virüsünün teşhisi, eğer doktor tarafından klinik muayenede konulamamış ise, halen kültür ve bazı durumlarda PCR ile yapılmaktadır fakat bu süreç birkaç haftayı bulabilmektedir. Hızlı ve düşük maliyetli virüs tespiti biyosensörleri henüz ticari olarak bulunmasa da bir biyosensörde kullanılması gereken hedefleyici molekül ihtiyacı aptamer ile sağlanabilecektir. Bu projemizde biyosensörlerde kullanılacak HSV1?e özgü aptamer geliştirilmeye çalışılmıştır. Bunun için SELEX yapılarak zenginleştirilmiş DNA havuzları elde edilmiştir
