Introduction. Benthic macroinvertebrates (BMIs) are widely used as bioindicators of water quality due to their sensitivity to physicochemical alterations caused by pollution. Their presence and community composition provide a comprehensive assessment of the ecological status of aquatic ecosystems. Objective. This study aimed to assess the water quality of the Cañipia River, located in Cusco, Peru, using three biotic indices: BMWP/Col, ABI, and EPT. Materials and Methods. Sampling was conducted at four stations during the dry and wet seasons. BMIs were identified at the family level to calculate diversity and biotic indices. Additionally, physicochemical parameters were analyzed, and heavy metal concentrations in water and sediments were determined. Results. The families Elmidae and Chironomidae were the most abundant. According to the BMWP/Col index, water quality ranged from critical to doubtful, while the ABI index indicated a poor to good status. The EPT index classified water quality as poor to moderate. Simpson’s index revealed fluctuating diversity, ranging from low to high during the dry season and from moderate to high during the wet season, whereas Shannon’s index indicated low to moderate diversity. Margalef’s index (DMg) was higher in the wet season. Regarding metal contamination, only station RCañi1, located upstream of the formal mining area, exceeded Peruvian regulatory limits for Ba, Cu, Mn, and Zn in water. Canonical Correspondence Analysis (CCA) showed seasonal relationships between metal concentrations and biotic indices. Conclusions. The three biotic indices suggest a moderate impact on the water quality of the Cañipia River, likely influenced by anthropogenic factors.Introducción. Los macroinvertebrados bentónicos (BMIs) son bioindicadores clave de la calidad del agua, ya que su sensibilidad a la contaminación permite evaluar integralmente el estado ecológico de los ecosistemas acuáticos. Objetivo. Evaluar la calidad del agua del río Cañipia, ubicado en Cusco, Perú, mediante la aplicación de tres índices bióticos: BMWP/Col, ABI y EPT. Materiales y Métodos. Se realizaron muestreos en cuatro estaciones durante las temporadas de estiaje y avenida. Los BMIs fueron identificados a nivel de familia para calcular índices de diversidad y bióticos. Adicionalmente, se analizaron parámetros fisicoquímicos y se determinaron las concentraciones de metales pesados en agua y sedimentos. Resultados. Las familias Elmidae y Chironomidae fueron las más abundantes. Según el índice BMWP/Col, la calidad del agua varió de crítica a dudosa, mientras que el índice ABI mostró valores de pobre a buena. Por su parte, el índice EPT indicó una calidad de agua de pobre a moderada. El índice de Simpson reflejó una diversidad fluctuante, con valores de baja a alta en estiaje y de moderada a alta en avenida, mientras que el índice de Shannon indicó una diversidad baja a moderada. El índice de Margalef (DMg) fue mayor durante la temporada de avenida. En cuanto a la contaminación por metales, solo la estación RCañi1, superó los límites permisibles peruanos para Ba, Cu, Mn y Zn en agua. Conclusiones. Los tres índices bióticos sugieren un impacto moderado en la calidad del agua del río Cañipia, probablemente influenciado por factores antropogénicos
