Development of Aptamers for Targeted Drug Delivery to Glioblastoma Multiforme Brain Tumors

Abstract

Bu çalışmada glioblastoma multiforme’yi özel olarak tanıyan aptamer probları negatif seçilim yapılmadan tekrarlı hücre SELEX’i temelli bir prosedürün kullanılmasıyla oluşturulmuştur. Seçilim sonrasında 454 sekanslama teknolojisi SELEX yöntemini izlemek için, biyoenformatik araçlar ise yüksek kapasiteli verilerden yararlanılarak aptamerleri tanımlamak için kullanılmıştır. Özellikle hedef hücreye bağlanabilen ve nanomolar düzeyinde ayrılma sabitine (Kd) sahip bir grup aptamer üretilmiştir. Seçilen aptamerler glioblastoma hücre hattına ait farklı türlere yüksek bağlanma eğilimi gösterirken, diğer kanser hücre hatlarına az ya da hiç bir bağlanma göstermemektedir. Bu çalışmada üretilen aptamerler glioblastoma hücreleri için moleküler işaretleyici keşfi için araç olmanın yanı sıra teşhis için kullanılan prob ve hedeflenmiş ilaç dağıtımı gibi farklı uygulama alanlarında kullanılma potensiyeline sahiptirler.In this study aptamer probes for specific recognition of glioblastoma multiforme were generated using a repetitive and broad cell-SELEX-based procedure without negative selection. The 454 sequencing technology was used to monitor SELEX, and bioinformatics tools were used extensively to identify aptamers from high throughput data. A group of aptamers were generated that can bind to target cells specifically with dissociation constants (Kd) in the nanomolar range. Selected aptamers showed high affinity to different types of glioblastoma cell lines, while showing little or no affinity to other cancer cell lines. The aptamers generated in this study is used as tools in some applications. First of all they were used as recognition elements for their specific target in microscopy. They displayed a distinct binding on their target with observable microscopy images. Also preliminary experiments are carried out with a selected aptamer to be used as drug delivery vehicl