Les contaminations fécales des eaux et des coquillages induisent des risques pour la santé humaine et des pertes économiques liées, entre autres, aux interdictions de baignade et à la fermeture des zones de conchyliculture. La réduction des apports à l’origine de cette contamination est facilitée par une identification précise des sources (humaines ou animales) qui peut aussi servir à hié rarchiser les mesures à adopter en cas de besoin. De nombreux marqueurs ont été proposés à ce titre durant les deux dernières décennies. Ils correspondent :-à des micro-organismes (bactéries, virus ou bactériophages) mis en évidence par des approaches culturales, biochimiques ou moléculaires; -à des molécules chimiques présentes naturellement dans les fèces ou associées à l’une des sources de pollution; -et à la mise en évidence de cellules spécifiques de l’hôte dissimulées dans les matières fécales. Cet article présente ces différentes methods d’identification des sources de contaminations fécales en décrivant leur utilisation et la nature des résultats qu’elles permettent d’obtenir. Le principal corollaire de cette revue bibliographique est qu’il semble nécessaire de coupler différents marqueurs pour pouvoir identifier les sources
