As frequências gênicas para os marcadores genéticos foram estimadas em um total de 63 animais da raça Nelore

COUTINHO, L. L.

FIGUEIREDO, L. G.

PACKER, I. U.

RAZOOK, A.

REGITANO, L. C. de A.

ROSA, A. J. de M.

RCAAP - Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal

Caracterização da raça Nelore e teste de paternidade e por marcadores moleculares.

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TtAnais da XXXIVReunião Anual da SBZ - Julho de 1997 - Juiz de Fora - MGCARACTERIZAÇÃO DA RAÇA NELORE E TESTE DEPATERNIDADE POR MARCADORES MOLECULARES1ARTUR J. DE M. ROSA2, IRINEU U. PACKER,3 LUCIANA C. A. REGITAN04, ALEXANDER RAZOOK5,L.G.FIGUEIRED05, LUIZ L. COUTINH031 Parte de cissertação de Mestrado em Ciência Animal e Pastagens, ESALQ, USP, Dep. de Zootecnia. CNPq, FAPESP2 Pós-graduação em Genética, Dep. De Genética, FMRP, S.P.3 Professores ESALQ-USP-Dep de Zootecnia, Laboratório de Biotecnologia Animal, Piracicaba-SP; • Pesquisadora do CPPSE-EMBRAPA- São Calos-SP; 5 Pesquisadores Instituto de Zootecnia-Sertãozinho-SP.RESUMO: As frequências gênicas para os marcadores genéticos RFLP Kapa-casefna (KpCn), ~-lactoglobulina (~LG) e hormônio de crescimento (GH) e os microssatélites IGF I, INRA-006, CSFM-50 e BM-1224 foram estimadas em um total de 63 animais da raça Nelore. A probabilidade deexclusão combinada para todos os marcadores alcançou 0,9089. Os resultados do teste depaternidade efetuados em 13 famflias acusaram erro de identificação em duas (:=15%). Apaternidade foi negada para três sistemas genéticos (CSFM-50, BM-1224 e INRA-006) em uma dasfamílias e em um (BM-1224) para a outra. Os testes de paternidade apresentaram probabilidade depaternidade variando entre 0,6115 e 0,9987 com média igual a 0,8814.PALAVRAS-CHAVES: Bovino, marcador molecular, microssatélite, Nelore, RFLP, teste depaternidade.NELORE BREED CARACTERIZATION AND PATERNITY TEST BY MOLECULAR MARKERSABSTRACT: Gene frequencies for RFLP (Kappa-Casein, ~-Lactoglobulin and Growth Hormone) andmicrosatellites (IGF I, INRA-006, CSFM-50 and BM-1224) were estimated in a sample of 63 Nelorebulls. Combined exclusion probability for ali markers was around 0,9089. The paternity test resultsconducted in 13 families indicated misidentification in two families (:=15%). Misidentification wereverified in three genetics systems (CSFM-50, BM-1224 and INRA-006) in one family and in one (BM-1224) for the other. The paternity probability were in the range of 0,6115 and 0,9978, with average of0,8814.KEYWORDS: Bovine, molecular marker, microsatellites, Nelore breed, paternity test, RFLP.INTRODUÇÃOVários programas de melhoramentogenético na raça Nelore utilizam os modelosmistos para obter estimativas do valorgenético (DEP) de características deimportância econômica. A metodologia deHenderson (1973) para a solução dos modelosmistos utiliza a matriz de parentesco dosanimais e permite obter estimativas do valorgenético com propriedades BLUP. Portanto,os erros de identificação de paternidade temefeito prejudicial sobre as estimativas das DEPe dos parâmetros genéticos (VAN VLECK,1970). Erros de paternidade podem atingir até20 % dos registros de animais em váriospaíses (RON et aI. 1995), reduzindomarcadamente o ganho genético anual dapopulação. A técnica de manejo reprodutivo,denominada reprodutor múltiplo, usada namaioria dos programas de seleção na raçaNelore causa grande prejuízo para aidentificação e avaliação dos animais(TROVO et aI., 1996), justificando assim arealização de teste de paternidade. As relaçõesde parentesco entre individuos podem serI verificadas por maio de varias categorias demarcadores genéticos e moleculares. Dentre osúltimos, destacam-se: RFLP, . DNA-fingerprinting' e mais recentemente osmicrossatélites loco específico por seremcodominantes, de boa distribuição no genoma,alto polimorfismo e facilmente obtidos por PCR.Estas caracteristicas facilitam a determinaçãoda origem dos alelos paternais e permitematingir a probabilidade de exclusão combinadasuperior a 0.99 sugerida por GJERTSON et aI.(1988). O teste só pode ser feito em animaispertencentes à populações caracterizadas paraos sistemas genéticos que se pretende utilizar.Isto significa que a probabilidade de paternidadeé dependente da frequência gênica dos alelosherdados do pai (BALDING e NICHOLS,1995).O presente trabalho tem por objetivo estimar asfrequências gênicas para os marcadoresgenéticos RFLP kapa-caseína, ~-Iactoglobulinae hormônio do crescimento e os microssatélitesIGF I, INRA-006, CSFM-50 e BM-1224 na raçaNelore e desenvolver um teste de paternidade.MATERIAL E MÉTODOSO polimorfisrno dos marcadores foiavaliado em uma amostra de 63 animais daMelhoramento Genético Animal 63raça Nelore, não aparentados em primeiro grau,provenientes de 23 rebanhos, dentre osparticipantes da "Prova de Ganho de Peso" de1995 do Instituto de Zootecnia de Sertãozinho-SP. O DNA foi extraído a partir de sangueperiférico. As regiões de interesse do DNAforam amplificadas pela PCR em tuboseppendorf de 0,5 ml, com volume final dereação foi 25 ul contendo, KCI 50 mM, MgCI21,5 mM, Tris-HCI pH 8,4 1° mM, dNTP (cada)0,20 !-lM, iniciador (cada) 0,2 !-lM, Taq DNApolimerase 0,5 u, DNA genômico 100 llg. Asequência de temperaturas empregada foi 1-desnaturação inicial 95°C (3 minutos), 2-desnaturação 95°C 1 minuto, 3- anelamentotemperatura de anelamento (TA) 30 segundos,4- extensão 73°C (1 minuto), 5- repetir 2,3 e 429 vezes, 6- extensão final 73°C (3 minutos) e7- resfriamento 4 °C (indeterminado). A TA paraGH, Schlee et aI. (1994), foi 58°C; KpCn,MEDRANO e COROaVA (1990a), 55 °C; ~LG,MEDRANO e COROaVA (1990b), 55°C;CSFM-50, MOORE et aI. (1994), 55°C; INRA-006, VAIMAN et aI. (1994), 58°C; BM-1224,BISHOPP et aI. (1994), 54°C e IGF I,BISHOPP (1994), 58°C. O fragmentoamplificado de cada RFLP foi digerido com asenzimas de restrição Alu I (1.0 u), Hinf I (2,5unidades), Hae I1I (12,5 unidades) parahormônio de crescimento, Kapa-caseína e ~-lactoglobulina, respectivamente. O produto dadigestão foi separado em gel de agarose 3 % eos fragmentos detectados em brometo de etídio.A eletroforese dos microssatélites foi efetuadaem sistema PAGE desnaturante. A detecçao foirealizada pela marcação radioativa dos primersUP com y 32 P- ATP. As frequência gênicas egenotfpicas foram estimadas por contagemsimples. A probabilidade de exclusão foicalculada utilizando a fórmula descrita porDaDOS et aI. (1996), probabilidade de exclusãocombinada (PEC), RON et aI. (1995) eprobabilidade de paternidade, DaDOS et aI.(1996).RESULTADOS E DISCUSSÃOAs frequências gênicas obtidas para osalelos 1 e 2 respectivamente dos RFLP foram:Kapa-casefna 0,913 e 0,087; ~-Iactoglobulina0,405 e 0,595; hormônio do crescimento nãoapresentou polimorfismo de substituição deleucina por valina. Os microssatélitesapresentaram as seguintes frequências: IGF I,dois alelos com frequências 0,262 e 0,738; BM-1224, sete alelos (0,008; 0,048; 0,46; 0,278;0,119; 0,079; 0,008), CSFM-50, cinco alelos(0,016; 0,270; 0,246; 0,151 e 0,317) e INRA-006com sete alelos (0,115; 0,008; 0,016; 0,19;0,429; 0,087 e 0,119). Os resultados daprobabilidade de exclusão (PE) estãoapresentados na Quadro 1. Os valores de PEobtidos para os microssatélites INRA-006. BM-1224 e CSFM-50 foram satisfatórios, o mesmonão pode ser afirmado para o IGF I ou para osRFLP. A PEC (0,9089) entretanto, esteveaquém do ideal (0,99). Ainda assim, a análisedos genótipos de 13 famíliastouro/vaca/progênie participantes do teste depaternidade, possibilitou a exclusão depaternidade em duas famílias em três sistemasgenéticos (BM-1224, CSFM-50 e INRA-006) eum sistema (BM-1224). respectivamente. Osresultados do teste de paternidade. descritos naQuadro 2, apresentaram probabilidade depaternidade entre 0,6115 e 0,9987. com média0,8814. Somente 3 famílias atingiram os 0,99recomendados. Ainda assim esta frequência deerro na identificação atingiu 15% (2113),semelhante ao obtido em outros países (RON etaI., 1996). Se este valor for representativo parada raça Nelore evidencia-se a necessidade deum controle mais eficiente sobre os registrosgenealógicos. O teste de paternidade poderiaser aplicado na avaliação de touros emfazendas que utilizam reprodutores múltiplos(TROVa et aI., 1996), ou em um programa deavaliação de touros jovens. objetivandoaprimorar a predição do valor genético,realizando o teste em um número prédeterminado de animais para se atingir aacurácia desejada.CONCLUSÕESAs frequências encontradas para os, locos KpCn e ~LG são concordantes com osvalores descritos na literatura, sugerindo que aamostra é representativa da raça Nelore. Osmicrossatélites CSFM-50, BM-1224 e o INRA-006 apresentaram polimorfismo satisfatório, econsequentemente probabilidade de exclusão(PE) adequados para se proceder a um teste depaternidade. O mesmo, não ocorreu para osmarcadores RFLP KpCn, GH . ~LG e domicrossatélite IGF I.O valor de 0,9089 para a PEC(Probabilidade de Exclusão Combinada) foimenor que 0,99 recomendado para fins deteste de paternidade. Portanto outrosmarcadores microssatélite devem seradicionados para se atingir a PE pretendida.Outras técnicas de análise (p. ex multiplex) sãonecessárias para aumentar a rapidez do teste ediminuir os custos relativos a genotipagem dosanimais, viabilizando o uso comercial de teste depaternidade. A amostragem deverá serampliada para caracterizar as diferenteslinhagens existentes na raça e melhorar aconfiabilidade do teste de paternidade, uma vez(IaXXXIV Reunião Anual da SBZ - Julho de 1997 - Juiz de Fora ', MG 64s animais seriam testados de acordo comfrequências alélicas da linhagem a quepertencem.O erro de identificação igual a 15%obtido neste trabalho justifica o uso do teste depaternidade em programas de melhoramentogenético. O teste de paternidade deveria seraplicado em varias situações práticas: (1) - emuma porcentagem dos animais registrados acada ano na associação, para verificar avalidade e consistência das informaçõesfornecidas pelos produtores; (2)- nos programasde seleção que utilizam da técnica dosreprodutores múltiplos, sempre que os custos doteste forem inferiores aos benefícios atuais efuturos; (3)- nos programas de avaliação detouros jovens, objetivando aprimorar aestimação do valor genético.REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS1-BALOING, O. J. E NICHOLS, RA A methodfor quantifying differentiation betweenpopulations at multi-allelic loci and itsimplications for investigating identity andpaternity. Genética, 96: 3-12,1995.2-BISHOPP, M, O.; KAPPES, S, M.; KEELE,J,W. A genetic linkage map for cattle.Genetics, 136: 619-639, 1994.3-0000S, K. G.; TATE, M. L.; MCEWAN, J.C.Exclusion probabilities for pedigree testingfarm animais. Theor. Appl. Genetics, 92:966-975, 1996.4-GJERTSON, O. W.; MICKEY, M. 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Avaliações genéticas em bovinos decorte utilizando estruturas de dados não-convencionais. Em elaboração. 1997.11-VAIMAN, O.; MERCIER, O.; MOAZAM,I. Aset of 99 cattle microssatélite:characterization, synteny mapping andpolymorphism. Mammalian Genome, 5:288-297, 199412-VAN VLECK, L. O. Misidentification and sireevaluation. J_ of Dairy Science, 53:1697-1703,1970.QUADRO 1-Probabilidade de exclusão (PE) para cada marcador genético eprobabilidade de exclusão combinada (PEC) para todos os marcadores.p-Iact GHPE °IGF I CSFM-SO llM-1224 INRA-OOó PEC0,9089KpCs0,0731 0,175999 0,156 0.5077 0,4406 0,521Familia4QUADRO 2- Probabilidade de paternidade (PP) para cada família.111 2 3 5 7 86 9 10PP 0,9944 0,9818 0,9368 0,7478 0,9906 0,9987 0,9224 0,6115 0,6985 0,9309 0,882

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/43869/1/digitalizar0050.pdf

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