Considerando a importância e distribuição da Melipona subnitida, antes encontrada em todo Nordeste brasileiro, hoje apresenta desequilíbrio entre populações devido ao extrativismo predatório e desmatamento, esse trabalho objetivou identificar possível variação morfométrica da população de uma comunidade rural de Água Branca-AL. Foram utilizadas asas de 36 operárias, as asas anteriores direitas foram removidas e dispostas entre duas lâminas seladas. As medidas foram realizadas a partir de imagens das asas e as medidas foram obtidas a partir do programa TpsDig. Foram realizadas a sobreposição de Procrustes e aplicada as análises estatísticas multivariadas (MANOVA), a partir dos programas estatísticos MorphoJ e PAST. Foram necessários os três componentes para explicar 63,8% da variação total dos indivíduos analisados, PC1 (29,10%), PC2 (24,17%) e o PC3 (10,53%). A partir da distância de Mahalanobis e distância de Procrustes observou-se que a maior proximidade morfológica ocorreu entre as populações da colônia J-61 e J-59, enquanto a maior distância foi observada entre as colônias J-60 e J-62. Na análise de UPGMA as populações J-61 e J-59 foram agrupadas em um mesmo ramo. Foi possível constatar variações na forma das asas entre esses indivíduos, fato a ser justificado pela ocorrência do fluxo gênico com a população natural ou facilitado pelo homem através de troca de colônias