O objetivo deste trabalho foi estimar a frequência haplotípica de vinte isolados de Xap oriundos de quatro regiões produtoras de feijoeiro comum no Brasil.Pôster - pós-graduação

CORTES, M. V. de C. B.

PAIVA, B. A. R. de

WENDLAND, A.

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1077º Seminário Jovens Talentos –Coletânea de Resumos...Frequência haplotípica de Xanthomonas axono-podis pv. phaseoliestimada por Rep-PCRBruna Alícia Rafael de Paiva1, Adriane Wendland ², Márcio Vinícius Márcio Vinícius de Carvalho Barros Cortes ³.O crestamento bacteriano comum causado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli(Xap) é, dentre as doenças de origem bacteriana, a que apresenta maior importância para a cultura do feijoeiro. A variabilidade genética e agressividade na população do patógeno já foi evidenciada anteriormente com a análise de isolados de Xap e Xff. A análise de regiões repetitivas por meio de amplificação por Rep-PCR é uma abordagem muito utilizada nos estudos de diversidade genética. O objetivo deste trabalho foi estimar a frequência haplotípica de vinte isolados de Xap oriundos de quatro regiões produtoras de feijoeiro comum no Brasil. Foram selecionados vinte isolados de Xap dos estados do PR, RS, SP e GO, que foram submetidos à extração do DNA de acordo com a metodologia proposta por Li & De Boer(1995) com pequenas modificações. Para a amplificação do DNA utilizou-se como iniciadores os oligonucleotídeos ERIC, REP e BOX. O dendrograma da Rep-PCR obtido pelo programa NTSYS-PC (versão 2.1), permitiu identificar a diversidade genética entre os vinte isolados de Xap, pela geração de seis, sete e onze haplótipos distintos para os iniciadores ERIC, BOX e REP, respectivamente. Sendo um total de vinte haplótipos combinados, mostrando alta variabilidade entre isolados.  Foi possível ainda separar os isolados analisados em dois grupos, onde o segundo grupo (Xap 126, Xap 99, Xap138), apresenta elevada distância genética do restante dos isolados. Os resultados evidenciam também a falta de correlação entre as regiões geográficas de origem e o perfil genético dos isolados. Esta falta de diferenciação geográfica pode ser devido à introdução de sementes contaminadas de diferentes regiões, e também devido à recombinação genética da bactéria. É possível que esteja ocorrendo algum mecanismo molecular como, mutações espontâneas decorrentes da infidelidade da replicação do DNA, ou ainda, conjugação, transdução e transformação. Vários autores estudaram a eficiência desta técnica para diversas espécies de bactérias, e encontraram resultados satisfatórios, além de constatarem a preferência de hibridização dos iniciadores REP e ERIC com bactérias gram-negativas. Neste sentido, a utilização conjunta dos iniciadores foi fundamental para avaliação da variabilidade genética dos isolados de Xap.1 Engenheira Agrônoma, Discente do Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas, UFG, Goiânia-GO, brunaalicia@hotmail.com  2 Engenheira Agrônoma, Dra. em Fitopatologia, Pesquisadora na Embrapa Arroz Feijão, Santo Antônio de Goiás-GO3 Farmacêutico, Analista na Embrapa Arroz Feijão, Santo Antônio de Goiás-GO

Frequência haplotípica de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoliestimada por Rep-PCR.

O objetivo foi estimar a frequência haplotípica de isolados de Xanthomonas axonopodis pv.phaseoli (Xap) oriundos de regiões produtoras de feijoeiro no Brasil

PAIVA, B. A. R. D.

WENDLAD, A.

BARROS, M. V. D. C.

117Tropical Plant Pathology 38 (Supplement), august 2013XLVI Congresso Brasileiro de Fitopatologia - Ouro Preto MGCopyright by the Brazilian Phytopathological Society.  http://www.sbfito.com.br BACTÉRIAS FITOPATOGÊNICAS177-1 Frequência haplotípica de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli estimada por Rep-PCR (Haplotype frequency of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli estimated by rep-PCR)  Autores: PAIVA, B. A. R. D. - brunaalicia@hotmail.com (UFG - Universidade Federal de Goiás); WENDLAD, A. (EMBRAPA - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária); BARROS, M. V. D. C.(EMBRAPA - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária)ResumoA análise de regiões repetitivas por meio da rep-PCR é uma abordagem muito utilizada nos estudos de diversidade genética. O objetivo foi estimar a frequência haplotípica de isolados de Xanthomonas axonopodis pv.phaseoli (Xap) oriundos de regiões produtoras de feijoeiro no Brasil. Foram selecionados vinte isolados dos estados do PR, RS, SP e GO, que foram submetidos à extração do DNA, e posterior amplificação com os iniciadores ERIC, REP e BOX. O dendrograma da rep-PCR obtido pelo software NTSYS-PC, permitiu identificar a diversidade genética entre os isolados, pela geração de seis, sete e onze haplótipos distintos para os iniciadores ERIC, BOX e REP, respectivamente. Sendo um total de vinte haplótipos combinados, mostrando alta variabilidade. Foi possível ainda separar em dois grupos, onde o segundo grupo (Xap 126, Xap 99, Xap138), apresenta elevada distância genética do restante dos isolados. Os resultados evidenciam também a falta de correlação entre as regiões geográficas de origem e o perfil genético. A falta de diferenciação geográfica pode ser devido à introdução de sementes contaminadas de diferentes regiões, e também devido à recombinação genética da bactéria. É possível que esteja ocorrendo mutações espontâneas, ou ainda, conjugação, transdução e transformação. Vários autores encontraram resultados satisfatórios para diversas espécies de bactérias, além de constatarem a preferência de hibridização dos iniciadores REP e ERIC com bactérias gram-negativas. Neste sentido, a utilização conjunta dos iniciadores foi fundamental para avaliação da variabilidade genética dos isolados.

Frequência haplotípica de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli estimada por Rep-PCR.

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/993187/1/cbf5.pdf

Frequência haplotípica de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoliestimada por Rep-PCR.

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