O uso de marcadores moleculares constitui-se em uma técnica rápida que elimina a interferência dos fatores ambientais inerentes aos marcadores morfo-agronômicos na caracterização da diversidade e na busca por genes de interesse em diversas espécies. A cultura da mandioca (Manihot esculenta Crantz) apesar de diversos trabalhos de caracterização molecular, ainda necessita de maiores informações sobre sua expressão gênica e marcadores associados. O marcador TRAP é uma técnica baseada em PCR, que utiliza informações de ESTs (Expressed Sequence Tags) para gerar marcadores polimórficos relacionados a genes candidatos (HU e VICK, 2003). Alguns marcadores moleculares foram desenvolvidos para mandioca a partir de ESTs, a exemplo de microssatélites (ZOU et al, 2011). No entanto, a técnica TRAP traz como vantagem, além da amplificação de genes candidatos, a capacidade de produzir perfil de amplificação com muitas bandas por gel, o que diminui o custo por informação de polimorfismo. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial de detecção de polimorfismo em regiões gênicas na cultura da mandioca com uso de marcadores do tipo TRAP
