Oenocarpus minor é uma palmeira perene conhecida popularmente por bacabinha e considerada de grande potencial socioeconômico na região amazônica, onde é utilizada para obtenção de alimentos (polpa e palmito), matéria prima para artesanatos e construção de casas. O presente trabalho teve por objetivo quantificar a variabilidade genética entre genótipos de bacabinha utilizando marcadores RAPD. Folíolos de folhas jovens foram coletados de dez genótipos de diferentes procedências conservados no Banco de Germoplasma de bacabas da Embrapa Amazônia Oriental para a extração de DNA total. A genotipagem foi realizada por PCR-RAPD utilizando 20 primers selecionados para a espécie. A matriz binária obtida foi utilizada estimar as similaridades genéticas, as quais foram agrupadas em dendrograma gerado pelo método UPGMA. Foram amplificados 222 marcadores com alto polimorfismo, 94,1%. As similaridades genéticas variaram de 0,21 a 0,63, com média de 0,36, ocorrendo as menores magnitudes entre dois pares 9 x 2 e 9 x 5 de diferentes procedências. O dendrograma permitiu a formação de três grupos distintos, demonstrando considerável variabilidade entre os genótipos avaliados. Tais resultados permitem concluir que os genótipos de bacabinha avaliados apresentam alto polimorfismo, expressando considerável variabilidade genética, embora 50% deles sejam da mesma procedência, com a formação de grupos distintos a partir de 36% de similaridade