Este trabalho teve como objetivo avaliar a associação entre nível de endogamia e potencial produtivo e atributos relacionados à qualidade da raiz de mandioca (Manihot esculenta Crantz). Foram avaliados 357 acessos de mandioca para seis características de importância econômica para a cultura da mandioca como produtividade de raízes frescas e de amido, teor de amido, amilose e compostos cianogênicos nas raízes e peso da parte aérea. A genotipagem foi realizada com 402 marcadores do tipo SNP (Single-Nucleotide Polymorphism). A maioria dos genótipos de mandioca (77%) possui alto nível de endogamia (acima de 0,50). Além disso, a análise de regressão não demonstrou nenhuma associação entre o alto nível de endogamia com baixo potencial produtivo dos acessos de mandioc
