O presente trabalho teve como objetivo avaliar a incidência de doenças em pomares cítricos cultivados nos sistemas convencional e orgânico nos municípios de Castanhal e Capitão Poço-PA. O monitoramento de doenças foi realizado com frequência quinzenal no período de junho/2011 a abril/2012 em um pomar localizado no município de Castanhal (cultivo convencional) e dois pomares no município de Capitão Poço (cultivo convencional e orgânico). A incidência de doenças foi avaliada com base na sintomatologia em 20 plantas, selecionadas ao acaso e previamente marcadas. Nas plantas amostradas nas três áreas, foram observados sintomas da mancha aureolada (Thanatephorus cucumeris), mancha graxa (Mycosphaerella sp.), podridão floral (Colletotrichum acutatum), feltro ou camurça (Septobasidium sp.), fumagina (Capnodium sp.) e alga (Cephaleuros virescens) com incidências entre 70,93 a 96,54%, 88,33 a 96,54%, 1,67 a 11,54%, 19,58 a 81,92%, 27,08 a 70,91% e 75,25 a 79,62%, respectivamente. A leprose (Citrus leprosis virus C - CiLV-C) foi diagnosticada apenas na área de cultivo orgânico no município de Capitão Poço com incidência em 8,75% das plantas avaliadas