A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é uma espécie monóica, com flores masculinas e femininas dispostas na mesma inflorescência, porém ocorrendo o fenômeno da protoginia. Com isso, a estrutura reprodutiva da mandioca é tipicamente de uma espécie alógama, porém com taxa de cruzamento e autofecundação facilmente manejável. Assim, a espécie possui alta heterozigosidade, mantida por sua propagação clonal. Apesar disso, não há barreiras genéticas ou fisiológicas que impeçam a ocorrência de autofecundações. A exemplo de outras culturas, como o milho, a exploração do fenômeno da endogamia em mandioca poderia contribuir de forma gradual e consistente para a obtenção de linhagens com genes favoráveis; redução da carga genética; identificação de mutações naturais ou induzidas; descoberta de alelos recessivos comercialmente úteis, a exemplo do waxy; facilitar o uso da estratégia de retrocruzamentos em linhagens homozigóticas; propagação via sexual, o que facilitaria a conservação e o intercâmbio de materiais e a limpeza de doenças viróticas e causadas por fitoplasmas. Apesar das inúmeras vantagens do uso de linhagens de mandioca, os trabalhos sobre o tema são recentes e escassos (Rojas et al., 2009; Kawuki et al., 2011). Além disso, não existem trabalhos desta natureza para doenças da mandioca. Assim, o objetivo deste trabalho foi analisar a depressão endogâmica em mandioca para doenças foliares