Este trabalho teve o objetivo de investigar a associação entre os marcadores BMS490, ETH10 do cromossomo 5; INRA133, ILSTS090 do cromossomo 6 e RM222, BMS2142 do cromossomo 19 de bovinos e a característica espessura de gordura subcutânea (EGS) na raça Canchim. Foi estudada uma amostra de 392 animais, composto por dois grupos genéticos: Canchim (5/8 Charolês + 3/8 Zebu) e MA, criados em regime de pasto na Embrapa Pecuária Sudeste, em São Carlos -SP, e na Fazenda Ipameri, em Jussara -GO. O DNA foi extraído de amostras de sangue pelo método de precipitação das proteínas com sal como descrito por Regitano (2001). Os microssatélites foram amplificados por reação em cadeia da polimerase (PCR) e analisados no equipamento ABI 3100 Avant (Applied Biosystems). As análises de variância foram realizadas usando o método de quadrados mínimos, com modelo estatístico que incluiu os efeitos de sexo, grupos genéticos; fazenda, mês e ano de nascimento, manejo adotado e genótipo do marcador. Apesar dos marcadores terem sido escolhidos para delimitar regiões associadas à deposição de gordura em outras populações de bovinos de corte, não foram encontrados efeitos significativos dos marcadores em relação à EGS, na população da raça Canchim estudada
