El uso terapéutico de plantas medicinales es una práctica común en regiones del mundo donde se presenta la malaria y desempeña un papel importante en la prevención y tratamiento de la enfermedad en zonas endémicas. En Colombia se estima que anualmente se presentan más de 60.000 casos de malaria (INS) y en algunas regiones del país se hace uso de preparaciones con plantas medicinales que incluyen especies del género Piper para tratar la enfermedad. En el presente trabajo se realizó la evaluación de la actividad antimalárica in vitro e in vivo de los extractos etanólicos y de fracciones de diferente polaridad de las especies vegetales Piper cumanense y Piper holtonii (Piperaceae), lo que permitió identificar fracciones con actividad antiplasmódica y aislar metabolitos secundarios del grupo de los fenilpropanoides, flavonoides, ácidos benzoicos, esteroides y terpenos. Adicionalmente se caracterizaron microscópicamente las hojas de las dos especies, realizando cortes transversales y longitudinales. De P. cumanense se aisló el cromeno ácido gaudichaudiánico, el ácido 4-metoxi-3-(3metil-2-butenil)-benzoico, la 2’,4’,6’-trihidroxidihidrochalcona y 3 flavonoides C-glicósidos. Además se aislaron β-sitosterol, estigmasterol y β-sitosterol-3-O-glucósido y se detectaron por CG-MS 6 terpenoides. De P. holtonii se aislaron los fenilpropanoides apiol y dilapiol como metabolitos mayoritarios y los flavonoides kaempferol-3-O-rutinósido y rutina, así como β-sitosterol y sitosterol-3-O-β-glucósido.Abstract. The therapeutic use of medicinal plants is a common practice in endemic from malaria regions in the world and plays an important role in the prevention and treatment of disease. In Colombia is estimated to occur annually more than 60,000 cases of malaria and in some regions it herbal preparations are used to treat the disease. In this work, in vitro and in vivo evaluation of antimalarial activity of ethanolic extracts and different fractions of P. cumanense and P. holtonii (Piperaceae) results in the identification of active antiplasmodial fractions and also in the isolation of secondary metabolites as phenylpropanoids, flavonoids, benzoic acids, steroids and terpenes. Additionally the leaves of the two species were characterized microscopically. In P. cumanense was isolated gaudichaudianic acid, 4-methoxy-3-(3-methyl-2-butenyl)benzoic, 2 ', 4', 6'-trihidroxydihydrochalcone and C-glycosides flavonoids. In addition were isolated β-sitosterol, stigmasterol and β-sitosterol-3-O-glucoside and were detected by GC-MS 6 terpenoids. In P. holtonii was isolated as major metabolites, phenylpropanoids, apiol and dillapiole, and flavonoids kaempferol-3-O-rutinoside, rutine, sitosterol and β-sitosterol-3-O-βglucoside.Doctorad