El aumento en la contaminación de las fuentes de agua y la escasez del recurso, hacen necesario el desarrollo de estrategias de manejo integral del agua en todos los sectores involucrados en su uso. En Colombia el sector MIPYME agroindustrial es especialmente atractivo para la elaboración de una metodología de manejo integral del agua, ya que los proyectos orientados al uso eficiente del recurso hídrico y a la minimización del impacto ambiental se ha identificado como prioritarios dentro de las agrocadenas. De esta manera se busca fomentar la competitividad y el desarrollo de un sector con alto impacto en la población más vulnerable del país, como la asociada al sector agrario y rural. Este documento presenta una metodología para elaborar propuestas de manejo integral de agua en MIPYMES del sector agroindustrial. La metodología recoge las principales estrategias de manejo integral del sector industrial, presentándolas en una forma que permita utilizarlas de manera sencilla y usando información básica. Se incluye una metodología para selección de alternativas atendiendo a múltiples criterios de selección, y una guía para la elaboración del diagnóstico frente al manejo del agua. El trabajo es complementado con la aplicación de la metodología a una microempresa agroindustrial productora de agentes de control biológico, donde además se realiza un estudio para el aprovechamiento de parte de sus aguas residuales. Los resultados muestran la eficacia de la metodología propuesta, evidencian la viabilidad técnica y sugieren la viabilidad económica del aprovechamiento de una parte de las aguas residuales de la empresaAbstract : The increase in the pollution of water sources and the scarcity of the resource, make necessary the development of strategies for integrated water management in all sectors involved in its use. In Colombia, the government has identified problems related to inefficient water use and environmental impact caused by small and medium enterprises (SME’s) of the agro-industrial sector. Because of this, agro-industrial related companies are especially attractive to elaborate a methodology for integral water management (IWM). Thus, the competitiveness and the development of that sector is fomented, achieving a positive impact in the rural population who are in a particular high vulnerability situation in this country. This document presents a methodology to make IWM proposals in SME’s of the agro-industrial sector. The methodology use basic information and covers the main IWM industrial strategies applying it in an easy manner. A specific methodology for the selection of possible water treatment alternatives through multiple decision criteria and a guide for the diagnostic step of water treatment are also included. This work is further complemented with the application of the proposed methodology to a small producer of biological control agents (BCA’s) company. In addition, a study was made in order to reuse part of the enterprise’s wastewater. The results obtained show the efficacy of the methodology used and leads to the conclusion that wastewater reuse is technically and economically feasibleMaestrí