Evaluación del desempeño analítico del diagnóstico molecular de leishmaniasis cutánea

Abstract

Resumen Las leishmaniasis comprenden un espectro de enfermedades parasitarias producidas por protozoos del género Leishmania. Colombia es uno de los 3 países con mayor número de especies de Leishmania que afectan a los seres humanos y la leishmaniasis cutánea es la forma clínica más frecuente observada en el país. Colombia no cuenta con un estándar de oro para el diagnóstico de leishmaniasis cutánea, siendo el examen directo la prueba de elección, la cual reporta una baja sensibilidad que varía en función de varios aspectos. Recientemente, métodos moleculares se han utilizado en el diagnóstico permitiendo detectar ADN en cantidades mínimas; en muchos estudios moleculares no se evidencia una adecuada evaluación del desempeño analítico de la técnica y blancos genéticos empleados, parámetros necesarios para hablar de sensibilidad y especificidad analítica. El objetivo de este trabajo fue evaluar el desempeño analítico de las técnicas de PCR convencional, PCR en tiempo real y LAMP para el diagnóstico molecular de las principales especies causantes de leishmaniasis cutánea determinando la exclusividad e inclusividad, Rango Reportable Anticipado, límite de detección, repetibilidad, precisión y porcentaje de positividad de las tres plataformas moleculares. Se concluyó que el marcador molecular ADNk utilizado en estos ensayos, a pesar de ser el más sensible, no cumple con el criterio de exclusividad de la técnica, el HSP70 presentó un límite de detección bajo en PCR convencional y similar en qPCR y LAMP, también presentó una baja reproducibilidad y en LAMP no cumplió con el criterio de exclusividad, finalmente el marcador 18S presento el mejor desempeño analítico en las tres plataformas.Abstract. The Leishmaniasis include a spectrum of parasitic diseases caused by protozoans of the genus Leishmania. Colombia is one of three countries with the highest number of Leishmania species that affect humans, being cutaneous leishmaniasis the most frequent clinical manifestation observed in the country. Colombia does not count with a gold standard for the diagnosis of cutaneous leishmaniasis, the test of choice is direct lesion examination which has a low detection sensibility that varies in function of distinct aspects. Recently, molecular assays have been used in the diagnosis allowing the detection of DNA in low quantities. Nevertheless, in many molecular studies no evidence of an adequate evaluation of the analytic performance of the technique and genetic targets used is demonstrated; preventing the definition of the sensitivity and specificity of the analysis. The aim of this study was to evaluate the analytical performance of PCR, qPCR and LAMP for the molecular diagnosis of the principle species of Leishmania identified as causative agents of the cutaneous form, by determining exclusivity and inclusivity, anticipated reportable range, limit of detection, test-retest reliability, precision and percentage positivity in the three molecular platforms. Results obtained in this study allowed to determine that the molecular marker kDNA used in these tests, despite being the most sensitive, does not comply with the exclusivity criterion of the technique. HSP70 presented a low detection limit in conventional PCR as well as in qPCR and LAMP, yet low test-retest reliability was identified and in LAMP exclusivity criterion was not fulfilled. Finally, the molecular marker 18s presented the best analytic performance in the three platforms analyzed.Maestrí