Analysis of plant dehydrin promoters

Abstract

Transcriptional regulation is an important mechanism of gene expression modulation. The two studies presented here looked at transcriptional control of dehydrin genes. In the first study, promoters of KS dehydrin orthologues from an arctic and temperate Oxytropis species were compared. A region in the promoter from the temperate species was identified to be responsible for the repression of expression of a reporter gene under the promoter’s control. In the second study, using de novo motif discovery, promoters of five subclasses of dehydrins were analyzed. It was shown that each subclass contains overrepresented motifs in their promoters, which could help explain dehydrins’ expression patterns in response to various environmental stresses.La régulation transcriptionnelle est un mécanisme important de la modulation de l'expression génique. Les deux études présentées ici ont examiné le contrôle transcriptionnel de gènes de type déhydrine. Dans la première étude, les promoteurs de deux orthologues de déhydrine KS des espèces arctique et tempérée du genre Oxytropis ont été comparés. Une région dans le promoteur de l'espèce tempérée a été identifiée comme étant responsable de la répression d'expression d'un gène rapporteur sous le contrôle du promoteur. Dans la deuxième étude, à l'aide de la découverte de motifs de novo, les promoteurs des cinq sous-classes de déhydrines ont été analysés. Il a été démontré que chaque sous-classe contient des motifs surreprésentés dans leurs promoteurs, ce qui pourrait aider à expliquer les profils d'expression de déhydrines en réponse aux divers stress environnementaux