Etude fonctionnelle du facteur sigma principal de Bacteroides fragilis

Abstract

Bacteroides fragilis est un germe anaérobie du tractus intestinal de l homme. Les promoteurs végétatifs de B. fragilis sont reconnus par un facteur sigma principal particulier (SigA), restreint aux phyla Bacteroidetes et Chlorobium. SigA possède un court segment basique, à la place de la région N-terminale 1.1 acide retrouvée chez tous les autres facteurs sigma principaux connus. Il contient des résidus "signature" dans les régions conservées 2 à 4, impliquées dans la reconnaissance des promoteurs et l interaction avec l ARN polymérase-cœur. Le segment basique de SigA conditionne le positionnement de l enzyme sur le promoteur et l étendue de la bulle de transcription. Le rôle de plusieurs résidus dans la formation du complexe ouvert de transcription et l interaction avec la séquence consensus -33 des promoteurs de B. fragilis est décrit. Cette thèse révèle l existence d un couple facteur sigma/promoteur unique au sein d un lignage majeur qui est apparu tôt dans l évolution bactérienne.PARIS-BIUSJ-Thèses (751052125) / SudocPARIS-BIUSJ-Physique recherche (751052113) / SudocSudocFranceF