Nouvelles méthodologie dans l'analyse protéomique par spectrométrie de masse (Application à la recherche de biomarqueurs dans le cadre des leucémies)

Abstract

Cette thèse porte sur le développement de nouvelles méthodologies pour l étude des protéines membranaires par spectrométrie de masse afin de trouver de nouveaux biomarqueurs dans le cadre des leucémies. Pour cela, nous avons élaboré une stratégie combinant la séparation de mélanges de protéines membranaires issues de microparticules sur gel d électrophorèse à une dimension, découpe systématique et analyse par nanoLC-MS/MS. A partir des résultats présentés dans cette thèse, nous avons pu mettre en évidence des protéines membranaires exprimées de façon différentielle entre les différents cas de leucémies.Dans un deuxième temps, nous avons appliqué la stratégie SELDI-TOF à des sérums de différents patients. Cette approche nous a permis de mettre en évidence trois protéines exprimées de façon différentielle entre le groupe témoin et le groupe malade. L expression de ces protéines de discriminer de manière non ambiguë les témoins des patients.This thesis deals with the development of new mass spectrometry strategies in order to study plasma membrane proteins and to find new specific biomarkers in various form of leukaemia. In this aim, we have developed an approach combining plasma membranes proteins originating from microparticles, separated on 1D gel electrophoresis, cut each 2mm and nanoLC-MS/MS analysis. From the results presented in this thesis, we have found various plasma membranes proteins as potential biomarkers expressed differentially in function of the different leukemia.In a second time, we have applied the SELDI-TOF strategy on serums originating from various patients. This approach has permitted the identification of three different proteins over expressed in the patient group. The quantification of these proteins allows the classification of the patients versus the controls.STRASBOURG-Sc. et Techniques (674822102) / SudocSudocFranceF