Caractérisation moléculaire de souches cliniques et végétales de Fusarium solani par multilocus sequence typing

Abstract

Les Fusarium sp. sont des champignons saphrophytes, fréquemment retrouvés dans l'environnement. Chez l'homme, ils peuvent être responsables d'infections profondes, potentiellement mortelles. Dans le but d'améliorer les connaissances épidémiologiques et d'avoir une vue d'ensemble de la génétique des populations des Fusarium sp., des techniques de typages sont nécessaires. Un schéma de MLST a donc été développé pour l'espèce fongique émergente, Fusarium solani. Cette méthode a été mise au point à partir de 37 souches épidémiologiquement distinctes et provenant de sources différentes (cliniques, environnement hospitalier, végétaux). L'analyse des polymorphismes obtenus à partir de 5 gènes de ménage a permis d'obtenir une technique discriminante à 98,3%, stable, reproductive, d'utilisation aisée et applicable entre différents laboratoires. Suite à ce développement et à cette mise au point, des souches cliniques et végétales de Fusarium solani ont été typées par MLST. Une analyse phylogénique a ensuite été réalisée à l'aide de deux méthodes différentes et des groupes de composition variable sont mis en évidence. Cette observation nous permet donc d'envisager l'hypothèse d'une adaptation différente des souches végétales à l'homme au cours de l'évolution. Les groupes de composition mixte souches cliniques / souches végétales seraient des groupes "d'évolution transitoire" où l'adaptaton à l'homme serait en cours bien que certaines souches soient toujours phytopathogènes. Il s'agit du premier schéma de MLST décrit pour l'espèce Fusarium solani qui permet d'évoquer l'évolution des souches phytopathogènes pour l'homme. Des études phylogénétiques plus détaillées et complémentaires sont indispensables pour étayer nos hypothèses.NANCY1-SCD Pharmacie-Odontologie (543952101) / SudocSudocFranceF