Etude de la variabilité génétique du VIH-1 en Côte d'Ivoire et relation avec la résistance aux antiviraux

Abstract

Le VIH-1 est caractérisé par une grande variabilité génétique. Dans les pays en développement où circulent la majorité des sous-types non B, la résistance naturelle aux antirétroviraux (ARV) due à la diversité génétique ou la résistance primaire liée à la transmission de virus résistants sont peu documentées. Nous avonscaractérisé la diversité génétique de variants VIH retrouvés dans une population de patients naifs de traitement antirétroviral à Abidjan, Côte d'Ivoire. Dans cette population virale appartenant majoritairement au recombinant CRF02_AG, nous avons montré que la prévalence des mutations de résistance augmentait régulièrement entre 1997 et 2004. Nous avons également caractérisé le génome entier de certains virus et décrit des recombinants secondaires impliquant dans leur structure génomique le CRF09_cpx et d'autres recombinants déjà décrits. L'ensemble de ces données constitue une base pour la poursuite d'un suivi longitudinal de la résistance et de la diversité génétique du VIH-1 en Côte d'Ivoire.One of the major characteristics of HIV is its high genetic diversity. In developing countries where HIV-1 non-B subtypes are predominant, few data concerning HIV-1 natural or primary resistance to antiretroviral drug are available. We characterized the genetic diversity of HIV-1 variants infecting drug-naive patients from Abidjan, Côte d'Ivoire. Most HIV-1 viruses were recombinant CRF02_AG. In this population, we showed an increasing frequency of key resistance mutations from 1997 to 2004. Moreover, a number of HIV-1 genomes were entirely sequenced. We characterized second-generation HIV-1 recombinants with genomic structure involving CRF09_cpx and other previously described recombinants. A continued monitoring of HIV-1 resistance and genetic diversity is necessary in Côte d'Ivoire.BORDEAUX2-BU Santé (330632101) / SudocPARIS-BIUP (751062107) / SudocSudocFranceF