Quantification des signaux fluorescents dans les images de biopuces

Abstract

L objectif de cette thèse est l étude de la quantification des signaux de fluorescence issus de biopuces (puces à ADN et à protéines), afin d améliorer la qualité des données brutes obtenues lors des étapes d acquisition et d analyse d images. La première partie de cette thèse concerne l étude des systèmes d acquisition disponibles afin d en optimiser les différents paramètres d utilisation. La seconde partie concerne l élaboration d une nouvelle stratégie d analyse d images visant à améliorer les mesures d intensité associées aux spots. La combinaison de différents algorithmes de segmentation associée à la mise en place de critères de qualité a ainsi permis de minimiser la variance des intensités, ainsi que celle des ratios d intensités, au sein de chaque spot. Lee résultats obtenus montrent que ces améliorations ont un effet notable sur l analyse différentielle en permettant une meilleure discrimination des gènes différentiellement exprimés. Ces analyses ont été menées sur une large variété d images de biopuces issues des différents projets réalisés sur la plateforme Puces-à-ADN Gif/Orsay (GODMAP).PARIS-BIUSJ-Physique recherche (751052113) / SudocSudocFranceF