Etude moléculaire et biochimique des interactions de la protéine hnRNP G avec l ARN

Abstract

La protéine hnRNP G est impliquée dans l épissage alternatif de plusieurs précurseurs d ARN messager. Pour mieux comprendre la spécificité de cette protéine, j ai étudié ses interactions avec les ARNs in vitro et in vivo. Un motif d ARN structuré dans une tige-boucle qui contient la séquence GGAAA a été identifié in vitro comme une cible potentielle d hnRNP G. Cet ARN m a permis d identifier un nouveau domaine d interaction avec l ARN dans la structure de l hnRNP G, situé dans sa région C-terminale et désigné C-ter RBD .Le modèle des chromosomes en écouvillon chez l amphibien m a permis de montrer qu un nouveau domaine situé au centre de la structure de la protéine et distinct de ses domaines d interaction avec l ARN est responsable de son recrutement au niveau des transcrits naissants des chromosomes. Ce domaine a été désigné Nascent transcripts Targeting Domain (NTD). Cette étude montre que l hnRNP G s associe avec la majorité des ARNs transcrits par l ARN polymérase II tout en montrant un recrutement plus important au niveau de quelques boucles des chromosomes. En particulier, l association de l hnRNP G avec les transcrits du bivalent sexuel ZW chez Pleurodeles waltl, montre un recrutement hétéromorphe au niveau de certains sites de ce bivalent.Au cours de ma thèse, j ai participé à la mise en évidence d une activité différentielle de liaison à l ARN liée au génotype sexuel, pour les isoformes de l hnRNP G dans l ovocyte de P. waltl. Les résultats suggèrent la présence d une famille multigénique de l hnRNP G répartie sur un autosome et sur les chromosomes sexuels. Cette étude contribue à la caractérisation de l hnRNP G et à la compréhension de ses fonctions.PARIS-BIUP (751062107) / SudocPARIS-BIUSJ-Physique recherche (751052113) / SudocSudocFranceF