Détection de Pseudomonas aeruginosa dans les expectorations de patients atteints de mucoviscidose (intérêt de la PCR en temps réel gyrB/ecfX)

Abstract

L'identification de Pseudomonas aeruginosa dans les expectorations des patients atteints de mucoviscidose (patients CF) est primordiale, mais peut s'avérer difficile. L'utilisation de la PCR pourrait améliorer le dépistage précoce de cette bactérie. L'objectif de notre travail a été d'évaluer les performances de la PCR en temps réel gyrB/ecfX dans ce contexte. La collection bactérienne d'étude se composait de 37 isolats de P. aeruginosa et de 41 isolats de bacilles à Gram négatif non fermentaires, phylogénétiquement proches de P. aeruginosa. Cinquante-sept de ces isolats provenaient de patients CF. La PCR multiplexe a montré une sensibilité de 100 %, une spécificité de 95 % et un seuil de sensibilité entre 10E3 et 10E4 UFC/mL. À l'issue de cette évaluation, la PCR multiplexe a été intégrée dans une étude visant à évaluer l'apport des techniques moléculaires dans le dépistage de la primo-colonisation à P. aeruginosa chez les patients CF.Identification of Pseudomonas aeruginosa from sputum of cystic fibrosis patients (CF patients) is essential, but may be problematic. The use of PCR could improve the early detection of this bacterium. The aim of this study was to evaluate a real time multiplex PCR targeting the gyrB and the ecfX genes for its ability to detect P. aeruginosa from CF sputum. We tested 37 P. aeruginosa isolates and 41 closely related non-P. aeruginosa Gram negative bacillus isolates, including 57 isolates from CF patients. The multiplex PCR showed a sensitivity of 100%, a specificity of 95%, and a sensitivity treshold between 10E3 and 10E4 CFU/mL. Following this assessment, the multiplex PCR was included in a study which aims to assess the contribution of molecular techniques in the early detection of P. aeruginosa in CF patients.RENNES1-BU Santé (352382103) / SudocSudocFranceF