Caractérisation des méthodes de liaison de la protéine ribosomique S à la sous-unité 30S du ribosome d'Escherichia coli par Résonance Magnétique Nucléaire

Abstract

La protéine S1, la plus grande des protéines du ribosome d Escherichia coli, est une protéine modulaire composée de six répétitions d un domaine conservé. Son rôle essentiel dans la cellule, notamment pendant le démarrage de la traduction, est de permettre la reconnaissance, par le ribosome, du site d initiation de la traduction des ARNm dont la séquence Shine-Dalgarno est dégénérée ou absente. S1 est également présente dans d autres complexes, notamment dans la réplicase du phage Q . Il a été montré que la région d interaction de la protéine S1 avec la polymérase de la réplicase était portée par les deux premiers domaines de la protéine, tout comme pour l interaction avec la sous-unité 30S. Cependant, si les fonctions de S1 sont bien connues, son mécanisme d action demeure incertain. Notre objectif est donc d étudier, par Résonance Magnétique Nucléaire à très haut champ, les bases moléculaires de l interaction de la protéine S1 avec la sous-unité 30S. J ai attribué les fréquences de résonance du squelette peptidique des domaines impliqués dans la liaison de S1 sur la sous-unité 30S, d abord sur un fragment composé de ces deux domaines, puis sur la protéine S1 entière. J ai également transposé les attributions des quatre derniers domaines de S1, obtenus à partir de fragments isolés, sur la protéine entière. Cela m a permis de mettre en évidence des comportements différents pour les deux domaines responsables de l interaction. Combinées aux informations obtenues au laboratoire sur l organisation des domaines de la protéine S1 liant l ARN messager, ces données permettent d établir des hypothèses sur l organisation de la protéine au sein de la sous-unité 30S du ribosomePARIS-BIUSJ-Physique recherche (751052113) / SudocSudocFranceF