Recherche de virus de l'hépatite C recombinants chez des patients multi-exposés

Abstract

Depuis 2002, 5 virus recombinants inter-génotypiques du virus de l'hépatite C (RF_2k/1b, RF_2b/1b, RF_2i/6p, RF-2/5 et RF_2b/6w) ont été mis en évidence chez des patients toxicomanes ou hémophiles. Le génome des virus recombinants inter-génotypiques appartient au génotype 2 en 5' et à un autre génotype en 3'. Le point de recombinaison entre les 2 génotypes se situe dans la région génomique NS2-NS3. La fréquence de survenue des recombinaisons n'est pas encore évaluée car les techniques de génotypage actuellement utilisées en pratique courante, basées l'analyse d'une seule région génomique, ne permettent pas de les détecter. Nous avons recherché des souches recombinantes de VHC dans une population de 63 patients atteints d'hépatite chronique C, usagers de drogues par voie intra-veineuse ou hémophiles. La recherche a été réalisée par séquençage puis analyse phylogénétique de 2 régions génomiques différentes, l'une en 5' du génome codant pour la protéine d'enveloppe E1, et l'autre en 3' codant pour la polymérase virale NS5B. La comparaison des analyses réalisées sur les 2 extrémités du génome n'a permis de mettre en évidence ni recombinants inter-génotypiques ni cas de co-infection dans la population étudiée. En dépit d'une prévalence qui parait actuellement faible, il parait nécessaire d'étudier les virus recombinants inter-génotypiques en recherche fondamentale et clinique afin de déterminer leur mécanisme de formation, leur épidémiologie mondiale, leur prévalence et surtout leur sensibilité aux traitements actuels et du futur. Leur diffusion pourrait amener à reconsidérer l'utilisation en pratique courante des techniques de génotypage basées sur l'analyse d'une seule région du génome.CLERMONT FD-BCIU-Santé (631132104) / SudocLYON1-BU Santé (693882101) / SudocSudocFranceF