Utilisation de l analyse protéomique dans la caractérisation des bactéries d intérêt probiotique

Abstract

La réglementation européenne 1924/2006 exige que toute allégation santé soit étayée par des preuves scientifiques fiables de nature clinique. Force est de constater que la majorité des fabricants de probiotiques actuellement sur le marché ne fournissent pas ces preuves, dans la mesure où les études cliniques sont onéreuses et où il y a un manque de méthodes satisfaisantes et abordables facilitant la sélection préliminaire des souches les plus prometteuses. Dans ce contexte, l objectif de ce travail de thèse a été de développer une méthode analytique globale, basée sur la protéomique, pour différencier les souches probiotiques des souches sans bénéfice pour l hôte, et pour essayer de comprendre certains mécanismes d interaction probiotiques/hôte. Parmi la large gamme de propriétés et d activités des bactéries probiotiques, nous nous sommes intéressés à la résistance aux conditions gastro-intestinales, à la capacité d adhésion au mucus, et aux activités hypocholestérolémiante et immunomodulatrice de souches de Lactobacillus casei et de Lactobacillus plantarum. Cette approche a permis d identifier des profils protéomiques particuliers susceptibles de constituer des marqueurs bactériens de propriétés et d activités probiotiques.The 1924/2006 European regulation requires health claims to be substantiated with relevant clinical data. There is no denying that most of the manufacturers of currently marketed probiotics do not provide such substantiation, inasmuch as clinical studies are expensive and there is a lack for satisfactory and affordable methods facilitating the preliminary selection of the most promising strains. In this context, this thesis aimed at developing a global analytical method, based on proteomics, to differentiate probiotic strains from strains with no advantage for the host, and to try to understand some of the probiotic/host interaction mechanisms. Among the variety of properties and activities of probiotic bacteria, we focused on the resistance to gastro-intestinal conditions, the adhesion to mucus, and the hypocholesterolemic and immunomodulatory activities of Lactobacillus casei and Lactobacillus plantarum strains. This approach enabled to identify particular proteomic profiles likely to represent bacterial markers of probiotic properties and activities.STRASBOURG-Sc. et Techniques (674822102) / SudocSudocFranceF