Microbiote et santé (caractérisation d'activités fibrolytiques aun sein du microbiote iléal de l'Homme)

Abstract

Le microbiote intestinal est représenté par une population microbienne anaérobie complexe et très diversifiée, responsables de nombreuses activités métaboliques. Les bactéries fibrolytiques, par exemple, jouent un rôle important dans la dégradation des fibres alimentaires. L'activité de dégradation de ces fibres alimentaires a été clairement démontrée dans le gros intestin mais semble également importante au niveau de l'iléon. Cependant, à ce jour, le potentiel génétique du microbiote iléal n'a pas été élucidé pour la dégradation de glucides complexes tels que les polysaccharides constitutifs des fibres alimentaires. Deux clones métagénomiques d'intérêt, possédant des activités cellulase et xylanase, ont été sélectionnés au sein d'une banque métagénomique iléo-mucosale. Grâce à des études bioinformatiques et la comparaison de leur séquence avec les gènes et génomes de référence du projet MetaHit, ces deux clones ont été identifiés comme appartenant respectivement aux espèces Bacteroides uniformis et Eubacterium rectale, deux bactéries connues pour leurs activités de dégradation des fibres alimentaires dans l'intestin. La prépondérance des protéines portées par ces clones a été déterminée au sein de 884 individus. Plusieurs glycoside hydrolases (CAZymes) sont retrouvées sur les séquences de ces clones, et sont potentiellement responsables des activités enzymatiques observées. Les gènes correspondants ont été étudiés par mutagenèse par transposition et sous-clonage, puis des tests d'activité enzymatique ont été réalisés à partir des extraits bactériens et extracellulaires des clones recombinants. Ces études ont permis de mettre en évidence la responsabilité de deux glycoside hydrolases spécifiques, possédant une double activité cellulase et xylanase, ce qui démontre qu'il existe des microorganismes capables de dégrader les fibres alimentaires au niveau de la muqueuse iléale chez l'Homme.CHATENAY M.-PARIS 11-BU Pharma. (920192101) / SudocSudocFranceF