BtID -Outils pour identifier, tracer et contrôler les contaminants de Bacillus thuringiensis de la fourche à la fourchette

Abstract

Bacillus thuringiensis ou Bt est une bactérie ubiquiste utilisée dans le domaine agricole en protection des cultures pour ses propriétés insecticides depuis les années 1950. Au niveau taxonomique, Bt appartient au groupe Bacillus cereus (sensu lato), qui contient également des souches pouvant être impliquées dans la qualité et sécurité des aliments. Même si l’utilisation de produits phytosanitaires à base de souches commerciales de Bt est un moyen efficace, facile d’utilisation et avantageux pour la protection des cultures, la persistance de spores sur les végétaux traités n’est pas toujours compatible avec les critères microbiologiques fixés pour leur utilisation dans les denrées alimentaires. Le projet BtID a permis (1) d’évaluer la diversité de B. thuringiensis et le positionnement de souches commerciales au sein du groupe B. cereus ; (2) de passer en revue les pratiques agricoles pour la protection des plantes à base de Bt ainsi que (3) de développer des méthodologies et outils d’aide à la décision permettant d’identifier, distinguer et tracer les souches de Bt autorisées au niveau européen, du champ à l’assiette. La collecte de ces souches commerciales a permis le séquençage du génome de trois représentants distincts majoritaires utilisés en biocontrôle, une caractérisation fine du comportement de ces souches hautement spécialisées, ainsi que d’étudier leur prévalence au niveau des matières premières (légumes) et produits finis (alimentaires transformés)