Sept des 17 familles de chauve-souris sont représentées sur l'île de Madagascar, dont une, est endémique, le #Myzopodidae. Trois genres, #Pteropus, #Emballonura et #Mormopterus, sont présents à Madagascar et en Asie mais pas en Afrique. Deux autres genres, #Eidolon et #Triaenops, existent à Madagascar et en Afrique, mais sont absents en Asie. Parmi les 28 espèces des chauve-souris malgaches, dont il existe des spécimens, 18 sont endémiques. Sur la base de leur distribution et des analyses phénétiques, dix espèces endémiques à affinités africaines et six à affinités asiatiques évidentes sont retenues alors que les données sur deux de ces espèces endémiques sont insuffisantes pour leur classification. Parmi les espèces non endémiques, neuf sont d'origine africaine, et une demande des études plus approfondies. (Résumé d'auteur