Brzi postupak identifikacije bakterija octenog vrenja tijekom submerzne industrijske proizvodnje octa, lokalizacijom 16S rRNA pomoću hibridizacije in situ i protočne citometrije

Abstract

Acetic acid bacteria are involved in many biotechnological processes such as vitamin C, gluconic acid, miglitol or acetic acid production, and others. For a technologist trying to control the industrial process, the ability to follow the microbiological development of the process is thus of importance. During the past few years hybridization in a combination with flow cytometry has often been used for this purpose. Since vinegar is a liquid, it is an ideal matrix for flow cytometry analysis. In this work we have constructed a specific probe for highly acetic acid-resistant species of the acetic acid bacteria and a protocol for in situ hybridization, which in combination with flow cytometry enables direct monitoring of bacteria producing vinegar with >10 % of acetic acid. The approach was successfully applied for monitoring microbiota during industrial vinegar production.Bakterije octenog vrenja koriste se u mnogim biotehnološkim procesima, između ostalog u proizvodnji vitamina C, miglitola (inhibitora α-glucozidaze), glukonske ili octene kiseline. Tijekom industrijske proizvodnje izrazito je važno omogućiti praćenje aktivnosti mikroorganizama radi kontrole postupka, pa se u tu svrhu u novije vrijeme često koristi hibridizacija in situ u kombinaciji s protočnom citometrijom. Ocat je tekućina, pa je idealan medij za protočnu citometriju. Pripremom nove specifične probe za sojeve bakterija octenog vrenja koji mogu rasti pri većim udjelima octene kiseline, te izradom novog protokola hibridizacije in situ, u kombinaciji s protočnom citometrijom omogućeno je izravno praćenje bakterija u proizvodnji octa s udjelom octene kiseline većim od 10 %. Metoda je uspješno upotrijebljena za praćenje mikrobiote tijekom industrijske proizvodnje octa