The Iberian Peninsula is close to the Saharan Desert, which is the biggest source of atmospheric aerosols of the World. Currently, it is recognized that atmospheric deposition of aerosols over ecosystems is a significant source not only of elements with gaseous phases but also of rock-derived ones. In the last years we have been quantifying the atmospheric flux of elements and substances of biogeochemical interest on the aquatic ecosystems of the South Iberian Peninsula, and their impact on their functioning and structure. The results we are obtaining indicate that atmospheric contribution of P and Ca are essential to explain the functioning of high mountain lakes, and that atmospheric input of organic matter partially supports the pelagic food web of these ecosystems. In this article we offer a summary of some of the results obtained to date.La Península Ibérica está próxima al Desierto del Sahara que es la mayor fuente de aerosoles atmosféricos del Planeta. Actualmente, se reconoce que la deposición de aerosoles sobre los ecosistemas es una entrada significativa no sólo de elementos con fases gaseosas sino, también, de elementos derivados de rocas. En los últimos años hemos estado cuantificado el flujo atmosférico de elementos y sustancias de interés biogeoquímico sobre los ecosistemas acuáticos del sur de la Península Ibérica y el impacto sobre su funcionamiento y estructura. Los resultados que estamos obteniendo indican que los aportes atmosféricos de P y Ca son esenciales para explicar el funcionamiento de los lagos de alta montaña y que las entradas atmosféricas de materia orgánica sostienen parcialmente las redes tróficas pelágicas de estos ecosistemas. En este artículo ofrecemos un resumen de algunos de los resultados obtenidos hasta ahora
